计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1133|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] 求助,vasp跑AIMD如何体现水环境?

[复制链接 Copy URL]

95

帖子

0

威望

395

eV
积分
490

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
小白求助,我现在需要对V2C在水中的氧化降解生成团簇进行AIMD模拟,现在有包含144个原子的CONTCAR,是直接将其复制成POSCAR接着在INCAR设置体现水环境的参数吗?
还是我需要在POSCAR中体现出水环境?
新手蒙昧,请大佬点拨一下,万分感谢!

361

帖子

0

威望

1989

eV
积分
2350

Level 5 (御坂)

所念皆星河

2#
发表于 Post on 2023-11-26 15:19:31 | 只看该作者 Only view this author
根据自己的实际计算需求选择使用显式溶剂模型还是隐式溶剂模型。
前者直接在盒子中加上水分子即可,后者编译vaspsol在INCAR中加上ISOL参数。
心之所向,日复一日,必有精进

95

帖子

0

威望

395

eV
积分
490

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-27 09:50:18 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2023-11-26 15:19
根据自己的实际计算需求选择使用显式溶剂模型还是隐式溶剂模型。
前者直接在盒子中加上水分子即可,后者编 ...

首先感谢您的回复,
但是为什么我在vasp手册中没有搜到ISOL这个参数呢?
也去vasp wiki 搜了一下,也没有相关的介绍。
能麻烦您给我讲解一下这个参数以及如何设置吗?

361

帖子

0

威望

1989

eV
积分
2350

Level 5 (御坂)

所念皆星河

4#
发表于 Post on 2023-11-27 09:53:47 | 只看该作者 Only view this author
XIEH 发表于 2023-11-27 09:50
首先感谢您的回复,
但是为什么我在vasp手册中没有搜到ISOL这个参数呢?
也去vasp wiki 搜了一下,也没 ...

详见 https://github.com/henniggroup/VASPsol
需在编译vasp同时编译好vaspsol才能使用
心之所向,日复一日,必有精进

28

帖子

0

威望

553

eV
积分
581

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2023-11-27 10:00:58 | 只看该作者 Only view this author
AIMD模拟一般都是显式水,直接根据盒子大小加入一定数量的水分子即可。但是你这个是没加水就144个原子?那估计很难跑动,可能需要考虑用cp2k

95

帖子

0

威望

395

eV
积分
490

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-27 10:07:37 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2023-11-27 09:53
详见 https://github.com/henniggroup/VASPsol
需在编译vasp同时编译好vaspsol才能使用

感谢

95

帖子

0

威望

395

eV
积分
490

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-28 17:01:45 | 只看该作者 Only view this author
yxzinc 发表于 2023-11-27 10:00
AIMD模拟一般都是显式水,直接根据盒子大小加入一定数量的水分子即可。但是你这个是没加水就144个原子?那 ...

感谢您的回复,目前刚接触,都学一下

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 15:25 , Processed in 0.163838 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list