计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 570|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 关于IRC单边跑后第一帧坐标与输入优化后过渡态坐标不一致,能量有异常的情况

[复制链接 Copy URL]

6

帖子

0

威望

19

eV
积分
25

Level 2 能力者

本帖最后由 pingju 于 2023-12-22 21:01 编辑

最近在算过渡态时,运用的先初猜过渡态,然后低级别下结构优化和震动分析,收敛后前后分开跑的IRC,然后对IRC得到的反应物和产物做结构优化,高级别下算单点,过渡态也是高级别下算的单点,发现存在两个问题:1、反应物单点能量高于过渡态单点能量500kJ/mol,严重异常   2、IRC输出文件中第一帧的坐标和输入的TS坐标不一样,想问下老师这是怎么回事? IRC没看出异常,附件是我计算的TS和IRC,烦请老师指导!

              (有两个输出文件太大了,压缩了)

TS-N1,2-PD-C2H5-CO-SCRF.gjf

6.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

SP-TS-N1,2-PD-C2H5-CO-SCRF.gjf

4.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

SP-TS-N1,2-PD-C2H5-CO-SCRF.LOG

73.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

R-IRC-N12-PD-C2H5-CO-SCRF.gjf

6.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

Rea-N12-PD-C2H5-CO-SCRF1.gjf

6.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

SP-REA-N12-PD-C2H5-CO-SCRF.gjf

4.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

SP-REA-N12-PD-C2H5-CO-SCRF.LOG

74.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

R-IRC-N12-PD-C2H5-CO-SCRF.zip

236.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

TS-N1,2-PD-C2H5-CO-SCRF.zip

664.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

285

帖子

0

威望

1805

eV
积分
2090

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-12-22 21:13:27 | 只看该作者 Only view this author
1. 一个加了色散校正一个没加
2. IRC第一帧跟过渡态最后一帧坐标一样的啊

6

帖子

0

威望

19

eV
积分
25

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-22 21:24:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 pingju 于 2023-12-22 21:30 编辑

输入文件一样,但是输出文件中第一帧导出的时候就不一样了,我都加色散校正了啊


202312222128431475..png (43.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202312222128431475..png

6

帖子

0

威望

19

eV
积分
25

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-22 21:31:59 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2023-12-22 21:13
1. 一个加了色散校正一个没加
2. IRC第一帧跟过渡态最后一帧坐标一样的啊

都加色散校正了,IRC输入文件的坐标和TS输出坐标一致,但是输出文件中第一帧和TS输出坐标就不一致了

285

帖子

0

威望

1805

eV
积分
2090

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2023-12-22 21:37:38 | 只看该作者 Only view this author
pingju 发表于 2023-12-22 21:31
都加色散校正了,IRC输入文件的坐标和TS输出坐标一致,但是输出文件中第一帧和TS输出坐标就不一致了

过渡态单点加了,反应物单点没加,好好检查一下

6

帖子

0

威望

19

eV
积分
25

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-22 21:44:31 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2023-12-22 21:37
过渡态单点加了,反应物单点没加,好好检查一下

谢谢!我加上试试!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 23:39 , Processed in 0.168126 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list