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[Multiwfn使用咨询] 用Multiwfn懒人教程,高斯部分一直在报错

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老师,您好,因为我不是做量化方面的,对这方面基本一窍不通。我想用Multiwfn算DNA分子的RESP拟合电荷,按照教程安装完高斯和Multiwfn,运行“./Resp.sh DNA.pdb -38 1 water”,一直在报错,我粗略看了一下,好像是高斯部分一直没办法运行,请问怎么解决

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发表于 Post on 2023-12-28 19:43:53 | 只看该作者 Only view this author
是你的Gaussian版本太低了
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2023-12-28 20:57:27 | 只看该作者 Only view this author
不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了,以后注意

计算RESP原子电荷的超级懒人脚本(一行命令就算出结果)
http://sobereva.com/476http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html

此文明确说了
注意Gaussian09 D.01版本之前不支持DFT-D3校正,因此用老版本者应当把脚本里em=GD3BJ关键词取消,相关信息看《DFT-D色散校正的使用》(http://sobereva.com/210)。


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-28 22:11:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-28 20:57
不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给 ...

好的,谢谢老师,我把脚本改正后,报了别的错,“Atomic number out of range in def2SV”,这是什么原因?

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发表于 Post on 2023-12-29 04:15:46 | 只看该作者 Only view this author
zhijiu 发表于 2023-12-28 22:11
好的,谢谢老师,我把脚本改正后,报了别的错,“Atomic number out of range in def2SV”,这是什么原因 ...

你的体系里真的有Ho元素?
如果你的pdb文件里不含元素信息,Multiwfn会根据原子名自动猜元素,很可能猜不对,诸如HO可能本身是氢的原子名,但Multiwfn以为是Ho
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-29 16:35:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zhijiu 于 2023-12-29 18:07 编辑
sobereva 发表于 2023-12-29 04:15
你的体系里真的有Ho元素?
如果你的pdb文件里不含元素信息,Multiwfn会根据原子名自动猜元素,很可能猜 ...

好的,谢谢老师。还有一个问题,就是我输入的结构电荷总数是-0.0631,我命令行输入的时候,程序没办法运行,电荷只能输入整数吗?

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发表于 Post on 2023-12-30 05:36:31 | 只看该作者 Only view this author
zhijiu 发表于 2023-12-29 16:35
好的,谢谢老师。还有一个问题,就是我输入的结构电荷总数是-0.0631,我命令行输入的时候,程序没办法运 ...

说清楚什么命令、往哪里输入、什么程序,完全不知道你说的是什么情况。提问时主动把问题交代完整,仔细看此文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-30 09:40:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-30 05:36
说清楚什么命令、往哪里输入、什么程序,完全不知道你说的是什么情况。提问时主动把问题交代完整,仔细看 ...

好的,老师,就是我用Multiwfn懒人教程运行时,输入“./Resp.sh 1.pdb -0.0638 1 water”没办法运行程序,但是如果我把电荷数改成-1,是可以正常运行的。我是想问,这个程序没办法算非整数电荷的分子基团的RESP吗

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发表于 Post on 2023-12-30 10:53:41 | 只看该作者 Only view this author
Gaussian根本没法计算净电荷不为整数的情况,这是基本常识
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