拼接两个炭纳米管优化问题怎么解决？

许豪铭 · 发表于 Post on 2023-12-27 23:36:32

老师您好，我将两个炭纳米管靠近，手动连了键，请问怎么用ms优化手动连接部分键长呀？
如果方法不对的话，请问有什么方法可以拼接两个炭纳米管吗？

哲人 · 发表于 Post on 2023-12-29 08:28:30

感觉这个分子里接口处的二面角肯定需要大量优化，但是一优化可能键就断了

许豪铭 · 发表于 Post on 2024-1-3 14:29:42

哲人发表于 2023-12-29 08:28
感觉这个分子里接口处的二面角肯定需要大量优化，但是一优化可能键就断了

您好，请问可以详细讲讲优化步骤吗

哲人 · 发表于 Post on 2024-1-3 20:19:20

许豪铭发表于 2024-1-3 14:29
您好，请问可以详细讲讲优化步骤吗

就是你先在chem中导入模型进行初步优化，然后拿保存的gjf文件去gaussian 09跑优化，你这个大小不建议用太高精密度，跑完你去用gaussVIew看看模型啥样子，键是不是都接上了

哲人 · 发表于 Post on 2024-1-3 20:19:55

但是MS优化的话，我不擅长

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[分子对接] 拼接两个炭纳米管优化问题怎么解决？