如何解释产物结构优化后得到反应物？

科研好难 · 发表于 Post on 2024-3-21 10:51:21

各位老师好，我在优化完成后的反应物结构基础上调整得到产物结构，在给产物进行结构优化时老是优化回反应物的结构，请问这是怎么回事？优化完反应物结构如图，我将红圈内C-O键断开，把羟基移至远离有机物的多个位置进行过优化，最后都优化回了反应物的结构状态。请各位老师指点一下，非常感谢！

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-21 11:20:23

说明你的初猜结构和反应物之间没有隔着势垒，顺着受力直接就优化到反应物的极小点了。也有可能实际上隔着势垒，但优化算法原因或某些步的步长太大，导致直接跑到反应物对应的势阱区域了。

科研好难 · 发表于 Post on 2024-3-21 21:12:03

sobereva 发表于 2024-3-21 11:20
说明你的初猜结构和反应物之间没有隔着势垒，顺着受力直接就优化到反应物的极小点了。也有可能实际上隔着势 ...

sob老师，要是没有隔着势垒的话是不是可以认为就目前这个反应物而言不太可能脱出这个羟基，也就是说这一步反应不太可能发生。这种情况是继续把OH摆到其他位置或者把步长改小试试呢？还是说直接换一个产物结构计算呢？

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-21 21:57:52

可以用更小步长
也可以尝试摆得更远，并且断键的两个原子都放得更靠近表面原子，使得断键后能够吸附（倘若是这个机理的话）

科研好难 · 发表于 Post on 2024-3-22 10:15:19

sobereva 发表于 2024-3-21 21:57
可以用更小步长
也可以尝试摆得更远，并且断键的两个原子都放得更靠近表面原子，使得断键后能够吸附（倘若 ...

好的，谢谢sob老师解答

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