计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 646|回复 Reply: 11
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 无机化合物m06算能量报错

[复制链接 Copy URL]

45

帖子

0

威望

270

eV
积分
315

Level 3 能力者

老板给了一个无机化合物用m06算能量,给我的是cif文件,我先用chem3D打开的时候显示文件打不开,之后我用gaussview将文件转换成了gjf输入文件,跑的时候显示进入301程序错误
之后我再用multiwfn将cif文件转换为gjf文件跑的时候同样显示301错误,不知道是哪里出了问题(附件是我的文件)请教各位老师帮忙看看是哪里出了问题 Bi2O2Se.cif (2.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)
Bi2O2Se.gjf (876 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2)
Bi2O2Se.out (107.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)


831

帖子

1

威望

7189

eV
积分
8040

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2024-2-3 18:38:26 | 只看该作者 Only view this author
周期性体系不宜使用gaussian计算。

45

帖子

0

威望

270

eV
积分
315

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-3 18:41:46 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-2-3 18:38
周期性体系不宜使用gaussian计算。

您好!那这个一般用什么计算呢?可是老板让我跑

831

帖子

1

威望

7189

eV
积分
8040

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2024-2-3 18:47:46 | 只看该作者 Only view this author
0325-ddd 发表于 2024-2-3 18:41
您好!那这个一般用什么计算呢?可是老板让我跑

常见周期性程序都可以,如vasp, qe, cp2k。

45

帖子

0

威望

270

eV
积分
315

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-3 19:19:40 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-2-3 18:47
常见周期性程序都可以,如vasp, qe, cp2k。

刚刚跟老师说了之后,chemdarw画了部分结构,没有周期性结构了,然后3d保存gjf之后Bi不见了,我不知道有啥影响没,完全不懂无机file:///D:/data/wechat/WeChat%20Files/wxid_e7sm1te6p8c522/FileStorage/Temp/fa5525a86305fb66c674fff6c44f67d.png

831

帖子

1

威望

7189

eV
积分
8040

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2024-2-3 20:36:30 | 只看该作者 Only view this author
0325-ddd 发表于 2024-2-3 19:19
刚刚跟老师说了之后,chemdarw画了部分结构,没有周期性结构了,然后3d保存gjf之后Bi不见了,我不知道有 ...

图片没传上来。

831

帖子

1

威望

7189

eV
积分
8040

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2024-2-3 20:46:31 | 只看该作者 Only view this author
需不需要(或适不适合)用周期性程序算,不是取决于你怎么画,而是取决于你要算的东西本身是周期性体系还是孤立分子。本身是周期性体系的,有些也可以建立适当的簇模型来用非周期性程序算,但不是最合适的选择。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2024-2-4 04:13:03 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-2-3 18:47
常见周期性程序都可以,如vasp, qe, cp2k。

CP2K是很好的选择,免费,速度极快,用Multiwfn创建输入文件极其方便(下文),而且还有北京科音CP2K第一性原理计算培训班进行完整系统的讲解
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html

Gaussian虽然支持周期性体系计算,但功能极弱,对于三维周期性体系速度极慢、基本没有实用性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2024-2-4 04:13:41 | 只看该作者 Only view this author
0325-ddd 发表于 2024-2-3 19:19
刚刚跟老师说了之后,chemdarw画了部分结构,没有周期性结构了,然后3d保存gjf之后Bi不见了,我不知道有 ...

仔细看置顶的社员必读贴了解怎么正确贴图

那叫chemdraw
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

45

帖子

0

威望

270

eV
积分
315

Level 3 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-4 10:50:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-4 04:13
仔细看置顶的社员必读贴了解怎么正确贴图

那叫chemdraw

谢谢sob老师,自己都没发现打错了chemdraw

45

帖子

0

威望

270

eV
积分
315

Level 3 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-4 10:59:52 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-2-3 20:46
需不需要(或适不适合)用周期性程序算,不是取决于你怎么画,而是取决于你要算的东西本身是周期性体系还是 ...

好的,谢谢,我再跟老师沟通一下看看

45

帖子

0

威望

270

eV
积分
315

Level 3 能力者

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-4 11:00:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-4 04:13
CP2K是很好的选择,免费,速度极快,用Multiwfn创建输入文件极其方便(下文),而且还有北京科音CP2K第一 ...

谢谢sob老师,我尝试下这个方法

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 13:21 , Processed in 0.212110 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list