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[综合交流] 一个分子可否拆开,分开算ECD,再整合起来看整体ECD趋势

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求助一下,有一个分子,算了完整分子的ECD,也和实验结果对上了,但是审稿人说我这么验证的可信度不高,所以之后想将这一个分子分成2个部分分别算ECD,断开处是柔性链,其中这2个部分的手性是有争议的,通过比较相对的±cotton效应来确定该分子的手性,出发的动机是想到cotton具有可加性,不知道这样的方法是否可行,分开算ECD的结果也不错。
**********************
就比如我整个分子cotton为正。分子拆分成(A,A‘),B
其中A,A’是手性对映体,B确定,B的cotton效应是负的,
A是正的,A‘是负的,那么可以确定整个分子是由A+B组成的,而不是A’+B,就确定了手性?且A的峰高绝对值大于B绝对值。
********************
还是说绕开ECD的计算机理,从反证法的角度出发



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2#
发表于 Post on 2024-2-22 17:01:30 | 只看该作者 Only view this author
如果链足够柔性且足够长,而且分子的两个部分之间没有显著的相互作用,那么可以。
不过考虑到计算误差(A和B的ECD信号峰位置都可能有误差,且误差可能不一样大),即使分开算A和B,可能可信度也不高。如果能从实验上测量A自己的ECD,和计算的A的ECD比,会比较好一些
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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