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[Amber] 求助: Amber + ddtpd 绘制自由能景观图

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各位老师好,我使用Amber模拟了蛋白小分子体系共200ns,然后提取10000帧结构计算了PC1和PC2,然后将PC1、PC2放入sob老师开发的ddtpd 程序中去计算,

我设置格点数据为60*60,result2文件中却只有3600行数据,请问该怎么看每行数据对应到哪一帧结构呢?


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发表于 Post on 2024-3-9 06:20:05 | 只看该作者 Only view this author
只有散点图里面每个点能够对应帧号。而把散点图用我的程序转化成了概率分布,显然有多少个格点就有多少条数据,跟帧号就没对应关系了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-9 09:46:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-9 06:20
只有散点图里面每个点能够对应帧号。而把散点图用我的程序转化成了概率分布,显然有多少个格点就有多少条数 ...

好的,谢谢老师

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