[GROMACS] 计算MMPBSA时，提示The atom 72000 in the complex index is not found in the top

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Willow0114

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发表于 Post on 2024-8-24 13:02:41 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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本帖最后由 Willow0114 于 2024-8-27 11:00 编辑

我在计算MMPBSA时，提示The atom 72000 in the complex index is not found in the topology file(我用2、3个模型计算都会报相同的错误)。我是将MMPBSA.in文件直接放到了整个模拟的文件夹中，其他文件也没有做更改，为什么会出现这个错误呢？我应该如何修改呢？（我想计算蛋白质和钙离子之间的MMPBSA，由于index文件过大，无法上传，就放了一个截图），谢谢大家！

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