ovito分析分子体系的有序度求助

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目的与思考：对分子晶体扩胞，并探究不同压缩程度下，末态模型发生形变的情况。

这里我想参考非晶的分析方法，定性地描述，不同的末态模型的有序度（长程）。
但是因为单个分子内部的构型在力场的约束下均较为稳定，如果我只考虑某一原子的RDF会出现很多近邻的峰，所以难以统一分析。
问题：请问是否能在ovito中直接定义单个分子的中心，并分析这些中心的RDF来实现目的？
或者我的理解是否有误，应该是通过其他方式分析有序度的。

谢谢！