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[VMD] 求助 用travis画出了空间密度分布图,如何不同密度显示不同颜色

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各位老师好,我做的是想看两块氧化石墨烯板,中间狭缝官能团周围水的空间密度分布,我用travis导入xyz文件进行处理得到了xyz文件和cube文件。将两个文件拖到VMD里面画出了图1,但是只能显示出一种颜色,想做出不同密度显示不同颜色,带有颜色卡的,这个不是很清楚该如何处理了,请教各位老师。图2是多年前师兄做出来的,不是很清楚怎么做出来的,我也想大概做成那样的效果。


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发表于 Post on 2024-5-3 20:10:43 | 只看该作者 Only view this author
这个Figure caption完全不严谨,等值面对应什么、isovalue都不提。记住只有两个不同格点数据才能绘制出填色等值面效果,只有一套数据只能显示处处颜色相同的等值面
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-4 09:55:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-3 20:10
这个Figure caption完全不严谨,等值面对应什么、isovalue都不提。记住只有两个不同格点数据才能绘制出填色 ...

谢谢sob老师,但是不是很理解,对于我这个来说怎么弄两个不同的格点数据,这个您能教一下我吗

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发表于 Post on 2024-5-4 17:15:47 | 只看该作者 Only view this author
liwenjin8019 发表于 2024-5-4 09:55
谢谢sob老师,但是不是很理解,对于我这个来说怎么弄两个不同的格点数据,这个您能教一下我吗

这个问题没意义
在仅有sdf的格点数据的情况下,本来图3-3就应当只有一种颜色才对。你前辈作图时用什么函数定义的等值面、用什么函数/方式进行的着色,你得问他
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-5 16:02:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-4 17:15
这个问题没意义
在仅有sdf的格点数据的情况下,本来图3-3就应当只有一种颜色才对。你前辈作图时用什么函 ...

sob老师,您知道对于动力学来说,画这样的空间密度分布,想显示出不同的颜色应该怎么画吗,之前的师兄已经联系不上了,现在不知道该怎么画这个了,问问您。

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发表于 Post on 2024-5-5 23:58:45 | 只看该作者 Only view this author
liwenjin8019 发表于 2024-5-5 16:02
sob老师,您知道对于动力学来说,画这样的空间密度分布,想显示出不同的颜色应该怎么画吗,之前的师兄已 ...

都说了,是没意义的问题
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