计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1343|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助:集群上GROMACS软件交互使用的问题

[复制链接 Copy URL]

85

帖子

0

威望

1550

eV
积分
1635

Level 5 (御坂)

本帖最后由 phosphorescence 于 2024-5-20 22:00 编辑

各位老师好,想要在超算集群上进行簇分析,因为中间要做两次选择,所以需要在提交脚本中实现交互式分析。客服给的方案是在提交脚本中加入以下模块,第一次选择时正常读取脚本中的部分了,但是第二个选择时候就无效。问客服以后说是输入文件有问题,但是我排查不出来哪有问题,因此向各位老师求助。

客服提醒需要加入的模块:
“<<EOF
3   (3代表要输入的数字,如果要输入别的参数可以任意修改)
4   (如果作业要输入多次的话,继续在两个EOF之内增加行数)
EOF”

输入文件和输出文件在这里
链接: https://pan.baidu.com/s/1uCpop206YpJ6_mx5D9g1oA?pwd=y4cv 提取码: y4cv 复制这段内容后打开百度网盘手机App,操作更方便哦







gmx.sh

334 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 6

slurm-5882198.out

5.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-5-21 00:26:43 | 只看该作者 Only view this author
参看北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)这页ppt的说明:
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 07:17 , Processed in 0.191952 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list