计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 101|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 如何查看几何优化失败的分子的能量走势?

[复制链接 Copy URL]

23

帖子

0

威望

188

eV
积分
211

Level 3 能力者

还没有来得及查看http://sobereva.com/61上关于几何优化失败的解决方案,因为在那之前我想先查看分子收敛失败后的能量趋势,但是载入.out文件时发现如截图的报错,并且打开后无法查看Results下的optimization。


我在GitHub上注意到例子中就算收敛失败了也能够看到能量趋势。请问这是怎么做到的?

我的参数如下:

#P opt freq m062x/genecp EmpiricalDispersion=GD3



-C -H -O -N -S -F -P 0
6-311G*
****
-Fe -Ni 0
SDD
****

-Fe -Ni 0
SDD


202409181452571183..png (61.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202409181452571183..png

202409181452335486..png (139.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202409181452335486..png

202409181452093653..png (16.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202409181452093653..png

105

帖子

0

威望

483

eV
积分
588

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2024-9-18 15:33:22 | 只看该作者 Only view this author
使用GaussView的时候确保"read intermediate geometries"被勾选了.

out文件,用文本格式打开,搜索"SCF Done:" ,后面的E(RM062X)的能量也就是结构优化每一步的能量.
need offer

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2024-9-18 16:42:58 | 只看该作者 Only view this author
M06-2X算这种体系自找挨批
好好看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
改成TPSSh-D3(BJ)

如果read intermediate geometries已经选了,当前大概率连几何优化一步都没做,自行看输出文件便知什么情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

23

帖子

0

威望

188

eV
积分
211

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-18 17:09:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Yuuya 于 2024-9-18 17:17 编辑
sobereva 发表于 2024-9-18 16:42
M06-2X算这种体系自找挨批
好好看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择

多谢社长解答,我之前在http://bbs.keinsci.com/thread-48177-1-1.html中问过m062x的作用,您似乎没有直接答复。我还是不太明白顶上m062x/genecp和结尾赝势基组的关系。我的理解是m062x是默认基组,但是结尾的sdd和6-311G*有更高的优先度是吗?

也就是说应该改成下方这样?

#P opt freq TPSSh-D3(BJ)/genecp EmpiricalDispersion=GD3



-C -H -O -N -S -F -P 0
6-311G*
****
-Fe -Ni 0
TPSSh-D3(BJ)
****

-Fe -Ni 0
TPSSh-D3(BJ)

105

帖子

0

威望

483

eV
积分
588

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2024-9-18 17:17:12 | 只看该作者 Only view this author
Yuuya 发表于 2024-9-18 17:09
多谢社长解答,我之前在http://bbs.keinsci.com/thread-48177-1-1.html中问过m062x的作用,您似乎没有直 ...

M06-2X是泛函,它不叫基组.
need offer

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2024-9-18 17:22:13 | 只看该作者 Only view this author
Yuuya 发表于 2024-9-18 17:09
多谢社长解答,我之前在http://bbs.keinsci.com/thread-48177-1-1.html中问过m062x的作用,您似乎没有直 ...

欠缺的知识太多,都无从回复,先把理论方法和基组分清楚再说
真应该通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)恶补各种相关知识

相关阅读
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
辨析计算化学中的任务类型和理论方法
http://sobereva.com/680http://bbs.keinsci.com/thread-38982-1-1.html
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 22:15 , Processed in 0.274680 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list