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[辅助/分析程序] 基于Shermo利用TST理论计算反应速率的问题

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楼主
各位老师好

我希望利用TST理论,计算反应速率常数
1.利用cp2k对反应物及过渡态做了振动频率分析
2.利用Sob老师开发的Shermo计算了500k和1000k下的热力学数据
如G,U等数据

3.在得到的文件数据中,关于配分函数(不同温度配分函数不同),有:
Total q(V=0);   
Total q(bot);      
Total q(V=0)/NA;   
Total q(bot)/NA;   

4. 如果利用自由能计算,则应该选择
Sum of electronic energy and thermal correction to G (自由能)

的过渡态和反应物的差值
5.如果利用配分函数计算,则应该选择
Sum of electronic energy and thermal correction to U (势垒)

的过渡态和反应物的差值
同时,对于配分函数,应该选择 Total q(V=0);   


以下是我的问题:
1. 我上述的过错是否正确?
2.对于利用自由能计算和利用配分函数计算两种办法,老师们更推荐哪一种?----气相反应
3.在利用Shermo计算热力学数据时,实际上我的反应总压力为绝压20kPa,同时包含惰性气体,那么在设置Shermo条件时,是否应该把压力修改成20kPa?或者反应物的总分压?

谢谢老师


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发表于 Post on 2024-5-20 02:47:01 | 只看该作者 Only view this author
用配分函数算和用自由能垒算完全等价,后者直观得多,和化学意义清楚、重要的自由能垒直接相联系
对研究的体系没有任何描述,其它的没法回答
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-22 15:00:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-20 02:47
用配分函数算和用自由能垒算完全等价,后者直观得多,和化学意义清楚、重要的自由能垒直接相联系
对研究的 ...

Sob老师,谢谢,我的研究体系如下:
三甲基镓(TMG)+NH3生成TMG・NH3
之后,分三步,脱甲烷
最后生成GaN单体
反应都是在气相中进行
TMG的摩尔分数为0.01%
NH3为摩尔分数为15%
其余为不参加反应的载气H2和N2
压力为20kPa
温度1100摄氏度

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发表于 Post on 2024-5-23 04:52:05 | 只看该作者 Only view this author
桂の猿 发表于 2024-5-22 15:00
Sob老师,谢谢,我的研究体系如下:
三甲基镓(TMG)+NH3生成TMG・NH3
之后,分三步,脱甲烷

算热力学量时压力设成对应实际反应物的分压
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-13 19:40:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-23 04:52
算热力学量时压力设成对应实际反应物的分压

好的。谢谢sob老师。

但是这就涉及一个新问题
我只知道反应物的分压。但是反应过程中的中间体以及过渡态的分压是不知道的,这样该如何处理?

谢谢老师

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发表于 Post on 2024-6-14 02:24:42 | 只看该作者 Only view this author
桂の猿 发表于 2024-6-13 19:40
好的。谢谢sob老师。

但是这就涉及一个新问题

对于研究反应,一般计算的是标准态自由能,每个物质都按1atm的情况来算
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-16 19:12:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-14 02:24
对于研究反应,一般计算的是标准态自由能,每个物质都按1atm的情况来算

好的,谢谢卢老师

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