Amber联用Gaussian 进行QM/MM模拟求助

t675210552 · 发表于 Post on 2024-8-8 21:59:03

本帖最后由 t675210552 于 2024-8-8 21:59 编辑

各位，近期研究一个酶促反应体系，刚好想借机会学习一下QM/MM模拟，但是计算不太顺利，在进行QM/MM MD模拟时，始终无法正确完成，查询一些信息也未能解决，遂求助各位老师，请不吝赐教。计算中gau_job.log报错信息如下图1截图，提交作业的文件如附件所示，我在看到MaxMem= 4026531840 信息时猜测是否我本地内存条太小限制，于是我租了个超算借点增大了qmmm_md.in中mem，还是有相同报错，目前进度卡住，还希望各位老师帮忙看看

abdoman · 发表于 Post on 2024-8-9 07:15:33

没有用过QM/MM

但是看出错信息， "Did not find a xxx" 和Gau_job.tpl
感觉是不是要提供电荷和自旋的信息？

t675210552 · 发表于 Post on 2024-8-9 08:11:41

abdoman 发表于 2024-8-9 07:15
没有用过QM/MM

但是看出错信息， "Did not find a xxx" 和Gau_job.tpl

这个我在我的qmmm_md.in这个输入文件中进行了定义，不知道在gau_job.tpl中是否还需要再定义，我试一下谢谢！

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