计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13428|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 柔性扫描的势能面应该如何看

[复制链接 Copy URL]

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

本帖最后由 xujian 于 2017-5-10 09:06 编辑

柔性扫描两个二面角后得到三维的势能面,贴近坐标轴的曲线上的极小值要不要考虑为局部极小值(如图红色圈圈处),ps:此图我认为只有一个极小值,不知正确与否,麻烦赐教!




6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125152

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2017-5-10 13:18:55 | 只看该作者 Only view this author
算不上极小点。
即便假设把图像再往左扫描一部分后会出现极小点,你图中红圈的位置也离那个极小点会有一定距离,因为红圈位置的梯度并不小。

另外,你这到底是刚性扫描还是柔性扫描?如果是柔性扫描,这种图不算是二维势能面图,势能面图必须通过刚性扫描来构造。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

588

帖子

0

威望

3310

eV
积分
3898

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-5-10 13:34:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-5-10 13:18
算不上极小点。
即便假设把图像再往左扫描一部分后会出现极小点,你图中红圈的位置也离那个极小点会有一定 ...

谢谢老师,我这个是柔性扫描,用的是opt=modredundant,此图是直接用gaussView查看log文件,然后输出的

205

帖子

0

威望

1732

eV
积分
1937

Level 5 (御坂)

4#
发表于 Post on 2018-3-2 16:50:17 | 只看该作者 Only view this author
博主 想问下,scan后的log文件如何做出这种图,也发站内信给你了,谢谢了
Shanghai JiaoTong University
欢迎关注我的推送号:AI计算生化

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125152

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2018-3-2 17:12:44 | 只看该作者 Only view this author
lijiayisjtu 发表于 2018-3-2 16:50
博主 想问下,scan后的log文件如何做出这种图,也发站内信给你了,谢谢了

gview打开,results里选scan,直接就能看到
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 14:47 , Processed in 0.166424 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list