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[新手求助] 0度转角的双层石墨二炔使用Gaussian优化后出现角度

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请教一下各位,在用Gaussian优化双层石墨二炔、石墨四炔、石墨六炔时的层间距应该为多少埃,石墨四炔石墨六炔的层间距与石墨二炔相同吗。我用的层间距3.4埃0度转角优化石墨二炔之后出现了角度, 这是我优化后的0度石墨二炔,这是我的gjf文件 graphyne2-0.gjf (9.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)


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发表于 Post on 2024-6-30 01:22:07 | 只看该作者 Only view this author
优化完了该多少就是多少
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-30 10:38:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-6-30 01:22
优化完了该多少就是多少

谢谢sob老师,那这个我要做0转角的双层,出现角度应该怎么解决

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发表于 Post on 2024-6-30 16:19:38 | 只看该作者 Only view this author
紫宸 发表于 2024-6-30 03:38
谢谢sob老师,那这个我要做0转角的双层,出现角度应该怎么解决

实验已知0转角的结构存在吗?如果客观上就不存在,那么不可能优化出来,优化出来反倒是错的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-30 17:43:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-6-30 16:19
实验已知0转角的结构存在吗?如果客观上就不存在,那么不可能优化出来,优化出来反倒是错的

好的老师,我去找一找

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发表于 Post on 2024-7-2 19:44:52 | 只看该作者 Only view this author
紫宸 发表于 2024-6-30 10:38
谢谢sob老师,那这个我要做0转角的双层,出现角度应该怎么解决

本来就不太可能0度转角,此时互斥作用显著。18碳环二聚体就是两层错开的:
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html

如果你是纯粹理论研究,想得到严格重叠构型下最理想的层间距,先让gview判断出实际的点群再优化,有可能优化过程中一直保持精确重叠的结构。如果保持不了,做刚性扫描,把其中一层的所有原子的Z坐标设成一个变量,对这个变量扫描,然后拟合曲线得到最低点
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