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[GROMACS] MD模拟GPU加速rerun时所遇到的问题

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就是请教一下大家,我这个做蛋白和配体复合体的分子动力学模拟,之前出现无法使用GPU加速的问题,然后在论坛上发现是要先跑没有能量组的,再跑有能量组的。目前是如图写的配置文件和命令,但是在rerun的时候这个报错应该说明还是损失了GPU加速的性能的,应该如何解决呢?

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md.mdp

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rerun.mdp

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-21 09:24:19 | 只看该作者 Only view this author
最后结果是这样的,有啥影响没啊

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发表于 Post on 2024-7-26 05:53:54 | 只看该作者 Only view this author
milkbear 发表于 2024-7-21 09:24
最后结果是这样的,有啥影响没啊

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)的ppt:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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