计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 15230|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 求助:文献Buckingham potential参数问题

[复制链接 Copy URL]

15

帖子

0

威望

1767

eV
积分
1782

Level 5 (御坂)

本帖最后由 Scenery 于 2021-3-7 00:02 编辑

可能我的问题是入门级别,但我还是不明白。

例如这篇文献里给了Si-O、O-O相互作用参数,没给Si-Si相互作用参数,可是在实际用LAMMPS做SiO2时,Si-Si相互作用可以忽略吗?应该不行吧,因为我试了如果用
pair_style 1 1 0 1 0
pair_style 1 2 xxxx xxxx xxxx
pair_style 2 2 xxxx xxxx xxxx
跑出来是错误的

还是说我遗漏了什么常识性的问题,希望大家帮我解答一下!

下载 (1).png (10.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 69)

Buck势

Buck势

下载.png (93.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 66)

文献

文献

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120137

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-3-6 23:58:12 | 只看该作者 Only view this author
贴图方式不对,其他人看不到。重新编辑帖子并仔细看置顶的新社员必读贴了解怎么正确贴图,此问题在这里还特意强调了:http://bbs.keinsci.com/thread-18961-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

3

帖子

0

威望

183

eV
积分
186

Level 3 能力者

3#
发表于 Post on 2021-6-2 17:38:06 | 只看该作者 Only view this author
  同求该力场的使用,文献未标注的元素是不是有什么标准参数可以差之类的?

1

帖子

0

威望

71

eV
积分
72

Level 2 能力者

4#
发表于 Post on 2022-5-8 15:29:56 | 只看该作者 Only view this author
Mapleyu 发表于 2021-6-2 17:38
同求该力场的使用,文献未标注的元素是不是有什么标准参数可以差之类的?

请问楼主解决这个问题了吗,同求

236

帖子

0

威望

5066

eV
积分
5302

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2022-5-9 03:08:39 | 只看该作者 Only view this author
你没有考虑静电作用吧

63

帖子

0

威望

223

eV
积分
287

Level 3 能力者

6#
发表于 Post on 2022-5-18 17:21:13 | 只看该作者 Only view this author
请问您解决该问题了吗?我在想,难道si-si间用其他势函数?

12

帖子

0

威望

758

eV
积分
770

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2022-12-3 15:51:45 | 只看该作者 Only view this author
组合规则,能算出来。https://doi.org/10.1016/j.molliq.2020.114697

9

帖子

0

威望

468

eV
积分
477

Level 3 能力者

8#
发表于 Post on 2023-4-5 15:52:25 | 只看该作者 Only view this author
楼主你解决了吗,我是lammps新手,花了老大的功夫,到最后快跑起来了,告诉我缺原子自己与自己的势……问题是文献中也没给啊……快吐了。

5

帖子

0

威望

37

eV
积分
42

Level 2 能力者

9#
发表于 Post on 2023-5-18 21:26:43 | 只看该作者 Only view this author
楼主你好,我想请问一下我使用buckingham势计算sio2的时候出现了这个报错是什么原因啊ERROR: Pair style buck/coul/long requires atom attribute q,是我的atom_style设置的不对吗。

55

帖子

0

威望

195

eV
积分
250

Level 3 能力者

10#
发表于 Post on 2024-7-11 19:23:58 | 只看该作者 Only view this author
想问一下,白金汉势如果要用在GMX里面要如何修改参数啊怎么把白金汉势转变为LJ势啊

134

帖子

0

威望

1664

eV
积分
1798

Level 5 (御坂)

11#
发表于 Post on 2024-7-22 16:12:47 | 只看该作者 Only view this author
看起来设置的没有问题啊,SI的一样是0,pair_coeff 1 1 0 0.1 0 #si-si

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 19:41 , Processed in 0.281961 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list