[建模与可视化] 请教切割原子层松弛原子

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发表于 Post on 2024-7-25 17:46:16 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

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我在做CaO吸附CO2的例子，我想问具有2个周期性超级单体的CaO（0 0 1）板模型×并切割了四个原子层。为了消除板坯-板坯边界效应，引入了 20 Å 的真空层，该CaO（0 0 1）周期性平板模型的底部两个原子层受到笛卡尔坐标和分数阶坐标的约束，上两层和吸附物完全松弛，这个操作是怎么进行的，我用ms一直做不好
我用ms对下面CaO晶胞直接扩胞放置上下两个CaO板，在中间用packmol填充CO2

CaO.cif

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CO2.pdb

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