求助：bf4离子的itp问题

打豆豆的灰鸭 · 发表于 Post on 2024-7-29 15:05:47

本帖最后由打豆豆的灰鸭于 2024-7-29 15:26 编辑

老师能帮我看一下这个bf4离子的itp文件吗，在能量最小化的时候分子结构破坏

参考文献

slxc920113 · 发表于 Post on 2024-7-29 15:12:46

gmx中能量的单位是kJ/mol，距离的单位是nm。所以你的力场数明显单位不对，导致数值偏小了，无法约束住bond。你需要诚意418.4

打豆豆的灰鸭 · 发表于 Post on 2024-7-29 15:29:10

本帖最后由打豆豆的灰鸭于 2024-7-29 15:50 编辑

slxc920113 发表于 2024-7-29 15:12
gmx中能量的单位是kJ/mol，距离的单位是nm。所以你的力场数明显单位不对，导致数值偏小了，无法约束住bond ...

文献给的单位是Kcal/mol，把单位换乘了 Kj/mol,我乘了4.184
我乘了418.4，确实可以了，谢谢啦

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