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[综合交流] lennard-jones势能函数,如何计算两个分子间作用势

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各位老师好,我想计算两个粒子之间的势能,固定一个CO2的距离,逐步改变另一个CO2与其的相对距离,计算不同距离下的势能。
我看到了sob老师论坛中,包括柔性扫描和刚性扫描两种,想请问各位老师,我上面说的这种计算方法算是刚性扫描吗?


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发表于 Post on 2024-8-21 11:22:34 | 只看该作者 Only view this author
只需要刚性扫描
直接扫描然后简单拟合得到的是分子间的LJ势,如果获得原子间的LJ势,参考下文里提到的文章的做法
使用Multiwfn计算原子的C6色散系数
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-21 16:03:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-8-21 11:22
只需要刚性扫描
直接扫描然后简单拟合得到的是分子间的LJ势,如果获得原子间的LJ势,参考下文里提到的文章 ...

想请问一下sob老师,离子和离子间的L-J势,也可以用这种方法进行计算吗?

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发表于 Post on 2024-8-22 00:55:59 | 只看该作者 Only view this author
hiramqdl 发表于 2024-8-21 16:03
想请问一下sob老师,离子和离子间的L-J势,也可以用这种方法进行计算吗?

有关键一点是分子间必须完全是色散作用主导才行。而离子-离子之间作用得到的总能量变化曲线肯定是极大程度是静电作用主导的,拟合出来的不可能直接对应LJ势。
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