集群升级，增加计算节点

whtu · 发表于 Post on 2016-12-20 17:00:47

大家好：
以前师兄搭建的集群，现在老师要我升级集群，增加计算节点。我对集群的了解不多，不知道该从哪些方面来考虑增加计算节点？而且以后课题组会跑MD，可能会用到GPU加速。现在集群的信息如图所示：

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-12-20 21:10:41

首先是预算。。。

whtu · 发表于 Post on 2016-12-20 21:29:13

liyuanhe211 发表于 2016-12-20 21:10
首先是预算。。。

预算在25万左右，主要是增加节点

sobereva · 发表于 Post on 2016-12-21 02:25:36

若无特殊情况，联系原厂家再增加节点数就完了

whtu · 发表于 Post on 2016-12-21 09:37:13

sobereva 发表于 2016-12-21 02:25
若无特殊情况，联系原厂家再增加节点数就完了

现在的节点是不支持GPU加速的，以后课题组涉及MD，不知道MD的GPU效果怎样？

sobereva · 发表于 Post on 2016-12-21 09:43:53

whtu 发表于 2016-12-21 09:37
现在的节点是不支持GPU加速的，以后课题组涉及MD，不知道MD的GPU效果怎样？

很理想
不过如果不着急，等以后真正开始大规模做MD时再添GPU也可以，到时候性价比更高。

whtu · 发表于 Post on 2016-12-23 14:28:39

sobereva 发表于 2016-12-21 09:43
很理想
不过如果不着急，等以后真正开始大规模做MD时再添GPU也可以，到时候性价比更高。

谢谢sob老师解答。我看GPU有双精度需求和但精度之分，请问一下做MD和CFD选哪一种比较合适？

sobereva · 发表于 Post on 2016-12-23 14:54:22

whtu 发表于 2016-12-23 14:28
谢谢sob老师解答。我看GPU有双精度需求和但精度之分，请问一下做MD和CFD选哪一种比较合适？

CFD不清楚，MD主要看单精度能力，对于GROMACS则是只看单精度

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