计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 286|回复 Reply: 7
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 求助,计算体系激发态间电荷密度差图后与这两激发态未求差的电子密度图对比,有差异

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

159

eV
积分
172

Level 3 能力者

本帖最后由 qingmo 于 2024-9-5 20:54 编辑

  老师同学们大家好!最近用Multiwfn根据此文方法(http://sobereva.com/429计算得到分子两激发态间(S1态到S10态)非弛豫电子密度差等值面图后。又将记录了第1和10的激发态自然轨道的.mwfn文件参考Multiwfn手册里4.6.2节的例子,分别做出其价层电子密度等值面图。
  由电荷密度差等值面图可以看到,只有上下两端区域是绿色得电子,逐渐调小isosurface值该区域仍是绿色而其他区域蓝色增大,因此猜测S10态只在上下两端电子密度更大,而其余区域应是S1态电子密度更大。然而由做出的价层电子密度图可以清楚看到,相比于S1态,S10态整体上,尤其是四个边区域的电子密度明显更为显著。
  请问激发态电子密度图为何与由电子密度差猜测的结果不同?

图片1.png (112.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

激发态间电子密度差图

激发态间电子密度差图

图片2.png (418.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

价层电子密度

价层电子密度

图3.png (393.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

图3.png

图4.png (115.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

图4

图4

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-5 09:12:49 | 只看该作者 Only view this author
当前得到激发态价层电子密度的方式不靠谱。Multiwfn手册4.6.2节的做法假定波函数文件里记录的是分子轨道,而当前你的轨道是自然轨道。
对于激发态获得价层电子密度最稳妥、严格的做法是:
(1)产生记录激发态自然轨道的波函数文件(你已经得到了),用Multiwfn主功能5计算电子密度并导出成cube文件
(2)载入基态波函数文件,在主功能6的子功能26里将价层轨道的占据数都设成0,再用主功能5计算电子密度并导出成cube文件
(3)利用Multiwfn手册4.13.2节介绍的格点数据运算功能,将(1)的cube文件与(2)的cube文件相减,然后观看到的等值面或者导出的cube文件就对应激发态价层密度了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

159

eV
积分
172

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-5 20:52:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qingmo 于 2024-9-5 20:57 编辑
sobereva 发表于 2024-9-5 09:12
当前得到激发态价层电子密度的方式不靠谱。Multiwfn手册4.6.2节的做法假定波函数文件里记录的是分子轨道, ...

  非常感谢卢老师的解答。按照您的指导算了这两激发态的价层电子密度,如图3。D:\图3
  然而可以看出其价层电子密度的图基本一致,无法用来和电子密度差图对比讨论。之后我又计算了另一分子两激发态的电子密度差和价层电子密度,如图4,其价层电子密度的图也是看不出区别。调整等值面值,两激发态电子密度图仍然看不出区别。
  请问老师,为何发生了电荷转移的两激发态的价层电子密度图结果几乎没区别呢?亦或是本来由态的价层电子密度图就难以观察出不同态的区别,如果这样的话,要想形象表征出不同态时电子密度的分布特征和区别,是不是只能像电子密度差,电子-空穴分析一样从两激发态间电子发生的改变入手,而不能像本例一样直接由观察不同态特征这一角度出发?

13

帖子

0

威望

159

eV
积分
172

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-5 20:56:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-5 09:12
当前得到激发态价层电子密度的方式不靠谱。Multiwfn手册4.6.2节的做法假定波函数文件里记录的是分子轨道, ...

抱歉老师,刚回答时忘了添加图片了,现在编辑到一楼的提问里了

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2024-9-6 00:21:09 | 只看该作者 Only view this author
qingmo 发表于 2024-9-5 20:52
非常感谢卢老师的解答。按照您的指导算了这两激发态的价层电子密度,如图3。
  然而可以看出其价层电 ...

图片2.png明显能看出来S1和S10价层电子密度的区别

图片3.png不知道你画的是什么

图4.png的情况S1和S3难以区分很正常。这个激发的空穴和电子摊得比较开,因此每个原子上电子数变化量非常少,导致等值面图上不可能区分得很明显
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

159

eV
积分
172

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-6 14:47:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-6 00:21
图片2.png明显能看出来S1和S10价层电子密度的区别

图片3.png不知道你画的是什么

抱歉老师,没有把图片说明讲清楚

图2的S1和S10价层电子密度,是先前由自然轨道根据Multiwfn手册4.6.2节做得,按老师的说法这种方式不靠谱

图3是依据老师的指导,重新严格对S1和S10价层电子密度做得计算,可以看出这种计算方式后S1和S10变得难以区分

对于图3严格计算后S1和S10为何也难以区分,我想是否可参考“老师您对图4中S1和S3难以区分这一情况所做的解释“。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2024-9-6 16:42:38 | 只看该作者 Only view this author
qingmo 发表于 2024-9-6 14:47
抱歉老师,没有把图片说明讲清楚

图2的S1和S10价层电子密度,是先前由自然轨道根据Multiwfn手册4.6. ...

可。同样的原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

13

帖子

0

威望

159

eV
积分
172

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-6 16:44:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-6 16:42
可。同样的原因

谢谢卢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 09:41 , Processed in 0.313753 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list