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[GROMACS] gromacs运行md直接结束

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本帖最后由 古与春分 于 2024-9-18 16:16 编辑

老师,我在通过md检查自己构建的方解石拓扑文件是否正确时,在通过输入gmx mdrun -deffnm npt -nt 8 -v 指令后,md直接结束了,请问是什么原因导致的,有什么解决办法了。

1.png (71.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

1.png

ffnonbonded.itp

6.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

forcefield.itp

928 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

npt.mdp

668 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

topol.top

125 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

mix.gro

147.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

calcite.itp

431.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

因为文件大小限制,删除了键角及其后面的内容

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发表于 Post on 2024-9-18 16:30:28 | 只看该作者 Only view this author
用Linux版,或者不用GPU加速,有什么问题到时候再说

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、节约下载耗时。很大的itp文件显然应当先压缩再上传
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-18 16:35:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-18 16:30
用Linux版,或者不用GPU加速,有什么问题到时候再说

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传 ...

好的老师,我试试

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