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[Lammps] 求助:循环每一帧轨迹文件进行小模拟,结果press为-nan

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本帖最后由 pumpkin111 于 2024-9-25 10:15 编辑

我用lammps做热解模拟,用的势文件是laspnn,体系只有CHO三种元素。因为不能用fix reaxff/species命令但是想得到species文件,所以想循环每一帧轨迹文件用reaxff做一个非常小小的模拟过程,来输出产物文件。然后我用轨迹文件中的某一帧做模拟,运行报错如下。但是用MS构建的初始模型没有报错并且输出了想要的Species文件。

WARNING: Fix qeq/reax CG convergence failed after 200 iterations at 0 step (../fix_qeq_reax.cpp:735)
WARNING: Fix qeq/reax CG convergence failed after 200 iterations at 0 step (../fix_qeq_reax.cpp:735)
Per MPI rank memory allocation (min/avg/max) = 73.27 | 77.51 | 82.9 Mbytes
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press
       0         1500    110428.05            0    115252.49         -nan

电荷平衡不收敛且压力显示不出来,应该是模型的几何结构不合理。请问各位老师,是应该修改in文件吗?还是说输出的轨迹不能作为模型文件呢?
in文件如下

202409231653388769..png (23.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 13)

202409231653388769..png

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