求助Gaussian单点能计算命令关键词怎么输才正确

www... · 发表于 Post on 2024-10-22 14:44:39

本帖最后由 www... 于 2024-10-22 20:03 编辑

高斯小白现在开始做计算以下是计算油酸分子单点能的计算文件内容出现的问题是一提交任务就显示计算失败，是不是我的关键词输入错误啊。请各位大神解惑，不胜感激。

#p m062x/def2tzvp scrf=(smd,solvent=water) geom=allcheck Guess=read
em=gd3

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0 1
O                9.66962600 1.53350900 -0.06664200
O                10.76972100 -0.40736000 0.23412000
H                11.52308800 0.21288900 0.19755700
C                9.64388200 0.32760400 0.08198400
C                8.40607500 -0.53609300 0.12277800
C                7.10997100 0.25341400 -0.04868800
H                8.50843300 -1.30225500 -0.65690900
H                8.41277100 -1.08297100 1.07479800
H                7.04405000 1.01537500 0.73783300
H                7.14111100 0.79702900 -1.00107100
C                5.87077500 -0.64418700 -0.00526300
C                4.56295100 0.13430300 -0.17402600
H                5.84851400 -1.19062200 0.94868600
H                5.94452500 -1.40733200 -0.79348700
C                3.31861000 -0.75714300 -0.13162600
H                4.49066300 0.89743600 0.61438600
H                4.58640600 0.68095000 -1.12790900
H                3.39016900 -1.51985500 -0.92073000
H                3.29601500 -1.30471100 0.82186500
C                2.01110300 0.02166800 -0.29882200
C                0.76358500 -0.87750500 -0.25173300
H                2.02968800 0.56612400 -1.25381800
H                1.93199600 0.78420200 0.48826500
C                -0.51309200 -0.11272400 -0.46163900
H                0.86419800 -1.65068000 -1.02895000
H                0.72730800 -1.40378600 0.71137300
H                -0.61225000 0.39556000 -1.42384400
C                -1.49667400 0.00891300 0.43411700
C                -2.77318900 0.77403600 0.22461900
H                -1.39740200 -0.49937900 1.39631800
C                -4.02144500 -0.12402700 0.27396800
H                -2.87246400 1.54806900 1.00118000
H                -2.73749700 1.29944000 -0.73899900
H                -3.94399800 -0.88725100 -0.51266700
H                -4.03901100 -0.66790000 1.22936200
C                -5.32872300 0.65554000 0.10824000
C                -6.57472600 -0.23364900 0.15365500
H                -5.30700700 1.20241600 -0.84576300
H                -5.39784500 1.41933300 0.89663500
C                -7.88315600 0.54482800 -0.01239000
H                -6.50436500 -0.99777200 -0.63426200
H                -6.59595500 -0.78027800 1.10784200
H                -7.95303200 1.30938800 0.77527600
H                -7.86165100 1.09124700 -0.96675700
C                -9.12966300 -0.34355100 0.03350100
C             -10.43875800 0.43432000 -0.13318700
H                -9.15199600 -0.88983400 0.98808100
H                -9.06021200 -1.10864300 -0.75386800
C             -11.67836200 -0.46246700 -0.08535400
H             -10.50704300 1.19866400 0.65368800
H             -10.41560100 0.97941700 -1.08732900
H             -12.59995700 0.11808300 -0.20697000
H             -11.64960300 -1.21609900 -0.88198900
H             -11.74179200 -0.99513400 0.87154900

1 4 2.0
2 3 1.0 4 1.0
3
4 5 1.0
5 6 1.0 7 1.0 8 1.0
6 9 1.0 10 1.0 11 1.0
7
8
9
10
11 12 1.0 13 1.0 14 1.0
12 15 1.0 16 1.0 17 1.0
13
14
15 18 1.0 19 1.0 20 1.0
16
17
18
19
20 21 1.0 22 1.0 23 1.0
21 24 1.0 25 1.0 26 1.0
22
23
24 27 1.0 28 2.0
25
26
27
28 29 1.0 30 1.0
29 31 1.0 32 1.0 33 1.0
30
31 34 1.0 35 1.0 36 1.0
32
33
34
35
36 37 1.0 38 1.0 39 1.0
37 40 1.0 41 1.0 42 1.0
38
39
40 43 1.0 44 1.0 45 1.0
41
42
43
44
45 46 1.0 47 1.0 48 1.0
46 49 1.0 50 1.0 51 1.0
47
48
49 52 1.0 53 1.0 54 1.0
50
51
52
53
54

wal · 发表于 Post on 2024-10-22 14:56:06

#p 6-31g(d) scrf=(smd,solvent=water) geom=connectivity m062x/def2tzvp
这个突兀的6-31g(d)是什么玩意删了再跑看看
另外问报错最好把输出文件中的报错信息贴上来

wal · 发表于 Post on 2024-10-22 14:58:20

m062x好像也不支持BJ阻尼形式的色散校正，如果删了6-31g(d)还不行就把色散校正改成em=gd3

双黄蛋 · 发表于 Post on 2024-10-22 15:27:51

怎么写了两个基组？

双黄蛋 · 发表于 Post on 2024-10-22 15:28:38

wal 发表于 2024-10-22 14:58
m062x好像也不支持BJ阻尼形式的色散校正，如果删了6-31g(d)还不行就把色散校正改成em=gd3

之前试过明尼苏达确实不支持BJ

www... · 发表于 Post on 2024-10-22 20:05:24

wal 发表于 2024-10-22 14:58
m062x好像也不支持BJ阻尼形式的色散校正，如果删了6-31g(d)还不行就把色散校正改成em=gd3

谢谢解惑，我把6-31g（d）删了，还是跑不出来，em=gd3也改了，也还是跑不出来，我上传了计算失败的文件，麻烦大佬看看。

wal · 发表于 Post on 2024-10-22 20:30:59

本帖最后由 wal 于 2024-10-22 20:38 编辑

www... 发表于 2024-10-22 20:05
谢谢解惑，我把6-31g（d）删了，还是跑不出来，em=gd3也改了，也还是跑不出来，我上传了计算失败的文件， ...

geom=allcheck Guess=read
你新加的这两个命令的意思是从%chk指向的检查点文件里读取坐标和初猜信息，你如果写了就不用再提供几何坐标了，但是%chk指向的文件必须要对。可以是你结构优化之后产生的chk文件。
如果你是想正常用gjf文件里的坐标去计算，就把这两个关键词删了

另外，你把geom=connectivity删了，几何坐标后面的键连关系就没用了，也给删了再跑试试

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-23 12:55:05

%chk指定的路径不存在
提示写明了
Structure from the checkpoint file: "/public1/home/t0s000841/software-t0s000841/gaussian16-test/HOLinputE1.chk"
FileIO operation on non-existent file.

别人回复后，不要编辑主贴，否则别人之前回复的内容全都作废，还会令其它读者迷惑，好像之前的人回答得不对似的

如果死活搞不懂，索性甭写geom=allcheck Guess=read，或者chk文件路径换个短点的免得写错。

根据前面别人的回复，输入文件里的硬伤太多，建议参加北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html）一次性系统地学个明明白白，免得踩各种坑白浪费时间，或者任务跑起来了实际上结果都是错的还浑然不知。

www... · 发表于 Post on 2024-10-23 14:07:40

sobereva 发表于 2024-10-23 12:55
%chk指定的路径不存在
提示写明了
Structure from the checkpoint file: "/public1/home/t0s000841/sof ...

好的，谢谢sobereva老师

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