求助，粗粒化md模拟之后映射到全原子

tokifc · 发表于 Post on 2024-8-1 16:50:56

各位大佬好，我最近在入门粗粒化模拟，在md之后的反向映射中遇到了问题报错如图

md.gro是最终的模拟结果
topol.top是由 gmx pdb2gmx -f model54.pdb -o model54_H.pdb -ignh -water spce 得来的

top文件如图

用到的文件都在文件附件中

bw.zip (802.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

CAOPEIFANG · 发表于 Post on 2024-10-24 01:00:28

请问楼主解决了吗？我现在也遇到了相同的问题

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[粗粒化/DPD] 求助，粗粒化md模拟之后映射到全原子