MD模拟时是否需要将膜结构固定住？

lucky1999 · 发表于 Post on 2024-3-2 15:44:54

各位老师，我的课题是研究锂离子通过多层COF膜的相关性质。请问在MD模拟过程中，我是否需要将中间的膜结构冻结or位置限制or完全放开(模型图如下所示)？我已尝试将整个膜结构全部放开，统计了在模拟过程中膜最左侧和最右侧在z轴上的坐标，如下图所示。谢谢各位老师！

thor · 发表于 Post on 2024-10-30 19:16:51

你这看起来是2D COF，这孔应该很大吧，全放开不会变形很大？

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[GROMACS] MD模拟时是否需要将膜结构固定住？