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[Sobtop] 求助:在计算自由基拓扑结构时遇到【 Error by link 9999】

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本帖最后由 卡卡-14 于 2026-3-11 17:07 编辑

我想构建一个自由基态的底物,看这个底物在自由基态下的构象在MD模拟时会怎么变化。
这个自由基结构是原来的小分子失去一个氢之后形成的
ligand.mol2 (2.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)
所以我根据自己对自由基的理解,把相应位置的氢直接删掉之后,然后保存成了mol2文件
radical.mol2 (2.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)
在用社长的懒人脚本,去计算RESP。
我理解中自由基是中性不带电荷的
而且试了一下 [自旋多重度]为1会直接报错。
所以我输入的命令是
./RESP.sh radical 0 2
算了很久很久之后,计算还是报错了,
RESP.err (959 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1)
请问该怎么解决?






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