用VMD同时绘制手性分子的跃迁磁偶极和跃迁电偶极时矢量原点不重合怎么解决

zj-chem314 · 发表于 Post on 2024-10-30 11:08:12

请问各位老师、朋友，我在用VMD同时绘制手性分子的跃迁磁偶极和跃迁电偶极时，按照sob老师的帖子《使用Multiwfn+VMD绘制片段贡献的跃迁偶极矩矢量》和网友的经验已经同时画出来分子的跃迁电偶极和跃迁磁偶极如图所示，但是两个向量的原点没有重合在一块（已经将loaddip.tcl中的箭头长度增加两倍），怎样能够使两个矢量的原点重合而不影响其偶极矩呢，或者是否可以用gaussview画出类似效果的图

imasen · 发表于 Post on 2024-10-31 11:23:32

source一下这个小脚本，vmd命令行输入：

draw_arrow dx dy dz {color}

复制代码

color为可选项，默认蓝色，vmd的color_id(e.g. 0)或者color名(e.g. blue)都可以。默认箭头是从分子质心出发，箭头的大小可以在脚本内部改。

draw_arrow.vmd (1.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

sobereva · 发表于 Post on 2024-10-31 17:40:35

自己用恰当的命令画箭头就完了，参考下面的VMD tcl脚本例子举一反三，原点都在(0,0,0)

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[建模与可视化] 用VMD同时绘制手性分子的跃迁磁偶极和跃迁电偶极时矢量原点不重合怎么解决