求助Zn2+对氨基形成配位键有关电子和自旋多重度的设定

Zyyyy · 发表于 Post on 2024-11-12 20:26:59

本帖最后由 Zyyyy 于 2024-11-13 11:02 编辑

我们的想法是在一个3-氨基酚醛树脂的片段上，Zn2+与其上的氨基形成配位键，在书写GJF文件时，对电荷和自旋多重度的设定存在疑问，不知道该怎么设定
因为Zn2+取代了氨基上的一个氢原子形成了配位键，电荷应该设定为1 还是2呢
同时Zn原子的电子结构时3d10 4s2，在失去两个电子之后，Zn2+的电子结构就变成了3d10 此时是不是就成为了一个闭壳层的结构自旋多重度应该是1 但是尝试了2 1 这样去设置 Gaussian报错了 2 2可以正常运算。

Solitude198 · 发表于 Post on 2024-11-12 20:48:46

NH_2 + Zn^(2+) ==== NHZn(+) + H(+)

pikachuupup · 发表于 Post on 2024-11-12 20:49:23

看你下来的是氢原子还是氢离子，要是下来氢原子的话，总电荷应该是+2，自旋多重度当然是2；要是下来的是氢离子的话才是你说的闭壳层结构，自旋多重度是1，但是这时候总电荷就是+1了

sobereva · 发表于 Post on 2024-11-13 04:37:21

分清楚gif和gjf

Zyyyy · 发表于 Post on 2024-11-13 10:46:34

本帖最后由 Zyyyy 于 2024-11-13 11:02 编辑

sobereva 发表于 2024-11-13 04:37
分清楚gif和gjf

实在抱歉老师书写错误了

如果按照上面的回复说明那个氢原子或者离子在构建模型时应该放到哪了因为需要计算结合能片段的、Zn2+的、结合到一起的进行比较
需要单独计算一个氢离子或氢原子的单点能吗还是把氢离子放在无限远的位置与结合到一起的一起进行计算呢

Zyyyy · 发表于 Post on 2024-11-13 10:49:15

pikachuupup 发表于 2024-11-12 20:49
看你下来的是氢原子还是氢离子，要是下来氢原子的话，总电荷应该是+2，自旋多重度当然是2；要是下来的是氢 ...

麻烦再问一下下来的氢原子或者是氢离子在做构型搭建的时候是要放在与基团无线远的地方吗因为后面还要比较单点能基团的 Zn2+的和它们复合在一起的

pikachuupup · 发表于 Post on 2024-11-13 16:24:11

Zyyyy 发表于 2024-11-13 10:49
麻烦再问一下下来的氢原子或者是氢离子在做构型搭建的时候是要放在与基团无线远的地方吗因为后面还要 ...

单独计算

Zyyyy · 发表于 Post on 2024-11-13 19:19:12

pikachuupup 发表于 2024-11-13 16:24
单独计算

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[Gaussian/gview] 求助Zn2+对氨基形成配位键有关电子和自旋多重度的设定