计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 94|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] guess=read使用时报错chk文件无基组信息,是哪里出错了?

[复制链接 Copy URL]

3

帖子

0

威望

43

eV
积分
46

Level 2 能力者

在络合物三线态优化过程中使用关键词 #p opt freq def2svp em=gd3bj upbe1pbe无法收敛。
根据sob老师意见,使用小基组优化#p opt freq 6-31g(d) em=gd3bj upbe1pbe顺利收敛,得到chk文件另存为1116.chk;
后希望读取此优化下的波函数作为初猜,继续在def2svp下优化:
%chk=1116.chk
%nprocshared=32
%mem=100GB
#p opt freq def2svp em=gd3bj upbe1pbe guess=read

(输入文件名为1116.gjf)
然而运行很快报错:
Initial guess from the checkpoint file:  "1116/1116.chk"
Basis set data is not on the checkpoint file.
Error termination via Lnk1e in /public/home/ganlan/apprepo/gaussian/16-hy/scripts/../app/g16/l401.exe at Sat Nov 16 18:51:11 2024.

输出文件1116.log附于附件。
本人有机化学出生,纯自己摸索了一个月的计算化学入门的,基础很不扎实。感觉应该是犯了很低级的错误。各位前辈,能否指点一下是哪里出错了,怎么改进?

1116.log

51.94 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

输出文件

3

帖子

0

威望

43

eV
积分
46

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
def2svp下输入文件的坐标不是6-31g(d)优化完最后一帧的坐标
而是6-31g(d)那个优化的输入文件的坐标
这可能是报错的原因吗

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
从输出文件可见,明明你写的是%chk=1116/1116.chk,而不是你帖子里说的%chk=1116.chk
确保chk的路径写对了,并且确保确实chk文件是6-31G*任务直接产生的。
既然用def2-SVP进一步优化,显然结构也应当用6-31G*优化完的。应写上geom=allcheck从chk里面读取坐标

另外,6-31G*和def2-SVP大小几乎没多大差异,除非你还要给氢加极化(当前体系并不需要),否则直接用6-31G*的结果就完了

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

43

eV
积分
46

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
感谢老师回复,后面确认了一下路径确实有问题。感觉是超算slurm系统的客服帮忙编写的批量提交脚本有问题。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 10:52 , Processed in 0.169176 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list