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[其它] VMD程序不执行脚本?怎么办

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楼主
各位高人:

我看了很多帖子,关于 Multiwfn导出的cub文件,再用VMD程序打开可以套用脚本形成艺术级轨道或等值面图。
我反复尝试了多遍,Gaussian计算出CHK文件,转化为fch文件,然后调用Multiwfn导出的cub文件,这些都成功了。
VMD程序也安装了,可以运行,按照帖子里的方法,把找到的那个showcub文件复制过去,再修改VMD.RC文件
我感觉就是这里出了问题,插入指令source showcub.vmd指令没有发挥作用。

我发现2个问题,第1, 为什么VMD的程序命令中录入  cub ***  0.01后提示cub命令不识别,而直接把cub文件拖入display窗口中又能加载?这是为什么?

第2,在修改VMD.RC文件是没有搞清楚,是用记事本打开吗?进入后如下代码,如何加?是空一行吗?

# User's default values for newly loaded molecules/reps, etc
#  mol default color {colorID 5}
#  mol default style {NewCartoon 0.300000 6.000000 4.100000 0}
#  mol default selection {name CA}
#  mol default material {Transparent}
source showcub.vmd

这样写后运行VMD根本不起作用,请问各位高手,如果要调用脚本,代码后面应该怎么加啊?
还有,我发现我的笔记本电脑居然是64位的,是不是我的VMD程序版本错了,我用的是1.9.3版本。
盼求助,谢谢。



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发表于 Post on 2021-7-14 14:28:10 | 只看该作者 Only view this author
把source showcub.vmd
改成绝对路径,比如:
source {D:\Programs\VMD\showcub.vmd}
具体路径看文件实际所在位置。
设好重新打开程序。

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发表于 Post on 2021-7-14 15:21:24 | 只看该作者 Only view this author
看文字如果还看不明白,仔细照着文中的视频操作,还重复不出来那就无语了
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)
http://sobereva.com/449http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-8 09:59:59 | 只看该作者 Only view this author
电脑win10下面对文件写入受限制,解除了权限后可以看到指令正常,可以出图,cub命令可行。
但还有点问题是full.bmp文件好像不出来

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发表于 Post on 2024-11-18 11:34:57 | 只看该作者 Only view this author
winnerwill 发表于 2021-7-14 14:28
把source showcub.vmd
改成绝对路径,比如:
source {D:\Programs\VMD\showcub.vmd}

试了一下,是这样的,要写绝对路径

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