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[ORCA] 求与ORCA6配套的avogadro

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由于不会**上网,无法访问orca论坛了。
烦请大神帮忙从orca论坛下载linux和windous版本的avogadro软件(与orca配套)

已搜索本论坛,发现以下两个。一个是16年的,一个是19年的。
想要一个与orca6.0配套的avogadro。:
Avogadro最新版本软件,带ORCA插件版本
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 8&fromuid=50380
(出处: 计算化学公社)

Avogadro (ORCA enhanced version)
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 3&fromuid=50380
(出处: 计算化学公社)

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2024-11-18 17:26 编辑

有了Multiwfn,没必要用这个avogadro

详见  http://sobereva.com/multiwfn/         http://bbs.keinsci.com/thread-13560-1-1.html
又菜又爱玩

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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2024-11-18 17:25
有了Multiwfn,没必要用这个avogadro

详见  http://sobereva.com/multiwfn/         http://bbs.keinsci ...

谢谢。这是一个很好的建议。

求orca论坛上的avogadro是因为用它用习惯了。

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2024-11-18 21:28 编辑

根本不存在与orca6.0配套的avogadro,orca4.2.1以后Avogadro (ORCA enhanced version)就再也没有更新过(但新的avogadro程序本身是有一定对于orca的支持的)。
参见这里的讨论 https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=12486https://orcaforum.kofo.mpg.de/vi ... lit=avogadro#p49058

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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 popeyezheung 于 2024-11-18 19:13 编辑
hebrewsnabla 发表于 2024-11-18 18:21
根本不存在与orca6.0配套的avogadro,orca4.2.1以后Avogadro (ORCA enhanced version)就再也没有更新过(但 ...

谢谢。由于很久无法打开orca论坛网页( https://orcaforum.kofo.mpg.de/),所以以为随着orca6的发布也有配套新的avogadro版本。

由于你所提供的这两个网址无法打开(B。S。 一下所谓的科--------学--上--网),所以才冒昧地求个新版本的avogadro。
旧的(avogadro1.1.1)在使用,不知道什么原因,avogadro时不时地崩溃。

能不能麻烦你,提供一下与orca4.2.1配套的avogadro呢?



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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2024-11-18 19:41 编辑
popeyezheung 发表于 2024-11-18 19:10
谢谢。由于很久无法打开orca论坛网页( https://orcaforum.kofo.mpg.de/),所以以为随着orca6的发布也有 ...

如果一定要用可以试试avogadro 2,虽然也有问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-11-18 19:26
如果一定要用可以试试avogadro 2,虽然也有问题

已试过avogadro2,也体验了新的闪退。
一种新的体验,而且在extension里面缺少一部分功能。

所以转而还是寻求新一点的与orca配套的avogadro。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-11-18 19:26
如果一定要用可以试试avogadro 2,虽然也有问题

还是想用orca论坛所提供的avogadro的版本。

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发表于 Post on 5 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dnlx 于 2024-11-18 22:22 编辑

我用的是ORCA论坛链接的Avogadro 1.2.0,用来搭建分子结构、测量键长键角、观察ORCA输出的xyz轨迹和out文件里面的振动,一直没问题,ORCA 6的输出也一样看。

Avogadro 2 观察振动不方便,在显示xyz轨迹的时候不能同时显示键长键角变化。

Avogadro崩溃的原因经常是,观察振动的时候只暂停而没停止,然后再打开另一个分子结构,就会崩溃。

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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
作为ORCA 3.0时代过来的长期使用ORCA的用户,我从未没意识到有任何用Avogadro的必要(界面不怎么样,还容易崩溃)。ORCA的前后处理有理想选择:
建模用gview最理想
看轨道用Multiwfn(http://sobereva.com/269)或Multiwfn+VMD(http://sobereva.com/447http://sobereva.com/449)最快效果还最好
产生输入文件用Multiwfn最省事(http://sobereva.com/490
看优化过程、振动分析结果,用OfakeG+gview(http://sobereva.com/498)非常方便和完美
各种振动谱、电子光谱、NMR谱的绘制用Multiwfn很完美(http://sobereva.com/224http://sobereva.com/565
动力学轨迹用VMD看
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-19 08:34
作为ORCA 3.0时代过来的长期使用ORCA的用户,我从未没意识到有任何用Avogadro的必要(界面不怎么样,还容易 ...

很完美的回复。
谢谢。

我就想吃个山药蛋,解解饿。
大家都给我推荐满汉全席,我是吃呢,还是吃呢,还是吃呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
dnlx 发表于 2024-11-18 22:16
我用的是ORCA论坛链接的Avogadro 1.2.0,用来搭建分子结构、测量键长键角、观察ORCA输出的xyz轨迹和out文件 ...

orca论坛的链接打不开了。所以才想麻烦各位大神搬运一下。

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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
popeyezheung 发表于 2024-11-19 09:32
orca论坛的链接打不开了。所以才想麻烦各位大神搬运一下。

orca论坛始终正常
要以科研工作者的方式上网
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-11-19 11:32
orca论坛始终正常
要以科研工作者的方式上网

说得好。

可我不会上网。

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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 DapengDing 于 2024-11-19 22:24 编辑

Windows平台,把卢老师写的这个应用OfakeG.exe和这个脚本run_out_files.bat与orca输出的.out文件放在同一个文件夹里,双击脚本文件自动批量转化为fake.out,然后用gview丝滑的狠。http://sobereva.com/498

OfakeG.exe

1.61 MB, 下载次数 Times of downloads: 7

run_out_files.bat

695 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 7

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