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[Material Studio] Materials Studio生成化学键时键长不准确

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最近在做几类聚合物建模与优化时需要用到MS,发现在建模时MS会将许多重要的化学键键长等参数当做普通单键处理,如图所示,比如苯环内部键长应该是1.4埃左右,羰基键长应该是1.25埃左右。然而MS在指定键类型后仍然将键长自动设定为与碳碳单键及碳氧单键等同(尽管键级正确),经过dmol3与forcite等不同模块优化后键长仍然没有改进,也导致MS建模所得分子无法直接代入量子化学软件进行计算,需要手动修改键长。求教:MS的键长误差是否会对其本身的模拟结果产生较大影响?应当如何纠正这种误差,或者手动修改MS里碳碳双键等化学键的默认键长?

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图一:苯环键长错误

图一:苯环键长错误

微信图片_20241206211602.png (113.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

图二:羰基键长错误

图二:羰基键长错误

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发表于 Post on 2024-12-7 01:07:43 | 只看该作者 Only view this author
建立好模型后直接在cp2k、高斯等量化软件里进行几何优化,ms自带的量化模块不是很好

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发表于 Post on 2024-12-7 05:36:30 | 只看该作者 Only view this author
初始结构里键长差个0.1、0.2埃程度根本不是什么事,量子化学优化完了自发就调整合适了,没必要纠结于这种鸡毛蒜皮的事
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-12-7 12:05:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-12-7 05:36
初始结构里键长差个0.1、0.2埃程度根本不是什么事,量子化学优化完了自发就调整合适了,没必要纠结于这种鸡 ...

好的,感谢sob老师

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