伞形采样计算PMF后面曲线没有走平

thor · 发表于 Post on 2024-12-11 22:34:47

我定义了两种分子上的两个原子之间的距离，然后做伞形采样，两个分子距离远了之后没有走平收敛，可能是因为什么呢？尝试过更改小一点的力常数，感觉没有什么用。

thor · 发表于 Post on 2024-12-11 22:44:07

解决了。自己回复下，需要矫正一下。

含光君 · 发表于 Post on 2024-12-12 10:15:54

thor 发表于 2024-12-11 22:44
解决了。自己回复下，需要矫正一下。

请问下是怎么校正的呢？

thor · 发表于 Post on 2024-12-12 14:43:31

含光君发表于 2024-12-12 10:15
请问下是怎么校正的呢？

李继存老师的博文

含光君 · 发表于 Post on 2024-12-12 15:26:11

thor 发表于 2024-12-12 14:43
李继存老师的博文

谢谢lz

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[GROMACS] 伞形采样计算PMF后面曲线没有走平