计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 432|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Sobtop] 求助:使用sobtop生成.gro文件导入在VMD中发现键断裂

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

83

eV
积分
91

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
使用GauView生成的.mol2文件,导入到sobtop中生成.gro文件,结果在VMD中发现分子中有几个键断裂了,请问该从哪里入手解决呀

VT.mol2

8.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

VT.gro

6.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

72

帖子

0

威望

1491

eV
积分
1563

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2025-1-13 14:08:24 | 只看该作者 Only view this author
谈谈VMD可视化程序的连接关系的判断和设置问题http://sobereva.com/534

96

帖子

0

威望

604

eV
积分
700

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2025-1-13 22:55:33 | 只看该作者 Only view this author
VMD判断键连关系的原因,觉得是成键的你在可视化的时候直接连上就完事了

8

帖子

0

威望

83

eV
积分
91

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-17 17:57:40 | 只看该作者 Only view this author
lemon_electron 发表于 2025-1-13 22:55
VMD判断键连关系的原因,觉得是成键的你在可视化的时候直接连上就完事了

非常感谢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 05:23 , Processed in 0.152972 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list