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[波函数分析求助] GIMIC 2.0安装求助

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大家好!本人按照卢老师博客http://sobereva.com/491考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用),安装GIMIC时,在将GIMIC压缩包解压后进入此目录后运行了./setup --omp,并没有生成build目录,提示细节好像说明could not find Python.但是前面根据conda install cython numpy pyparsing安装cython时,提示安装成功。不知为什么,还请不吝赐教,谢谢!



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发表于 Post on 2025-12-11 17:25:35 | 只看该作者 Only view this author
要么用我博文里完全相同的系统以完全相同的步骤安装,要么联系作者,要么结合提示鼓捣,比如配置PYTHON_LIBRARY环境变量
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-12-12 11:25:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 乐平 于 2025-12-12 11:55 编辑

首先,GIMIC 有 2023年发布的 2.2.1 版,在 github 能下载
qmcurrents/gimic: Gauge-including magnetically induced currents.

其次,安装的时候先查一下 GIMIC 的官方手册
https://gimic.readthedocs.io/en/latest/installation.html

手册里关于 Python 的描述是用 Anaconda 2.x 版的…… 而现在的 Python 都是 3.x 版的了…… 所以,你的 Python 虚拟环境里应该使用 Python 2.7.x, 建立 Python 虚拟环境如下

  1. conda create -n GIMIC python=2.7
复制代码
上面命令的含义是:conda create 用 conda 创建虚拟环境, -n 代表输入虚拟环境的名称, GIMIC 是虚拟环境的名称,当然用任意名称也可以,这里用 GIMIC 代表你用的 GIMIC 这个软件,方便你记忆。 python=2.7 代表在 GIMIC 这个虚拟环境中安装 2.7 版本的 Python。

完成了上面的虚拟环境建立之后,等待 conda 安装完成 Python 2.7 ,然后进入 GIMIC 虚拟环境中,命令是
  1. conda activate GIMIC
复制代码

然后,你会在命令行前面看到 (GIMIC)这个提示,代表你进入了 GIMIC 这个虚拟环境。
再然后,在 GIMIC 虚拟环境中安装 cython, numpy, runtest=2.3.2 等其他依赖库。当然,最简单的方法是从提供的 requirements.txt 里直接安装。
  1. conda install --yes --file requirements.txt
复制代码

接下来,就可以正式进入 GIMIC 的安装过程了。
根据 GIMIC 的官方手册
https://gimic.readthedocs.io/en/latest/installation.html


如果你没有调用 Intel 编译器,那么
  1. ./setup
  2. cd build
  3. make
  4. make install</pre>
复制代码


如果你调用了 Intel 编译器,那么
  1. ./setup --fc=ifort --cc=icc --cxx=icpc --cmake-options="-D ENABLE_MKL_FLAG=ON"
  2. cd build
  3. make
  4. make install
复制代码

上面这些都是根据 GIMIC 的官方手册
https://gimic.readthedocs.io/en/latest/installation.html

另外,你是在哪里安装?自己的工作站? 课题组的服务器? 应该不是租的超算(因为你用了 root ……)
别安装什么都在 root 里执行,这是个坏习惯……

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-12 21:10:45 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2025-12-12 11:25
首先,GIMIC 有 2023年发布的 2.2.1 版,在 github 能下载
qmcurrents/gimic: Gauge-including magnetical ...

好的,谢谢。再尝试一下,自己的服务器

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-12 21:12:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-11 17:25
要么用我博文里完全相同的系统以完全相同的步骤安装,要么联系作者,要么结合提示鼓捣,比如配置PYTHON_LIB ...

谢谢卢老师!

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