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[综合交流] 求助,uESE模型是否拟合了由于结构改变导致的自由能变化

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本人在计算电荷为-1的有机体系的过渡态时,发现在SMD模型下和气相中经历了不同的反应机理,在过渡态的结构上存在一定的差异。请问对于这类无法优化得到气态结构的体系,若想要使用uESE模型计算溶剂化自由能:1.基于液相结构在气相下计算分子轨道以及CM5电荷用于uESE计算溶剂化自由能;2.直接使用气相过渡态结构计算溶剂化自由能。这两种方法哪一种更加合理呢?在两相结构不同时,使用uESE一般还能得到比SMD更好的结果吗?

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发表于 Post on 2025-4-9 04:40:38 | 只看该作者 Only view this author
问题的逻辑很迷。前面说“无法优化得到气态结构的体系”,后面又说“直接使用气相过渡态结构”
倘若有某个结构气相下无法得到而必须带溶剂模型优化,就用溶剂模型下优化的结构算其溶解自由能
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-9 18:19:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-9 04:40
问题的逻辑很迷。前面说“无法优化得到气态结构的体系”,后面又说“直接使用气相过渡态结构”
倘若有某个 ...

好的,感谢sob老师!

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