计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 339|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] 使用VMD作IGMH等值面图的反光问题求助

[复制链接 Copy URL]

18

帖子

0

威望

182

eV
积分
200

Level 3 能力者

在用VMD做IGMH等值面时,绿色的等值面和原子放大看都有反光如图1,但是过了一段时间重新做的时候就没有反光了如图2,调试了很久也不知道什么原因,完全按照文章中的方法做的,求助各位大神帮忙答疑解惑,万分感谢

1.jpg (150.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

图1:前期做的带反光

图1:前期做的带反光

2.jpg (109.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

图2:后期做的无反光

图2:后期做的无反光

1208

帖子

6

威望

2432

eV
积分
3760

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

2#
发表于 Post on 2025-9-3 15:57:23 | 只看该作者 Only view this author
有这种清晰反光的材质的Mirror属性大于0,VMD内置材质中只有RTChrome会这样,可以在Graphics - Materials窗口查看。(这和Opacity属性大于0的材质产生的阴影是两回事。)我记得是需要Tachyon渲染来产生的效果,靠Snapshot截屏就没有。
√546=23.36664289109

18

帖子

0

威望

182

eV
积分
200

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-3 16:55:19 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-9-3 15:57
有这种清晰反光的材质的Mirror属性大于0,VMD内置材质中只有RTChrome会这样,可以在Graphics - Materials窗 ...

我是按照做HOMO-LUMO那个方法做的

1208

帖子

6

威望

2432

eV
积分
3760

Level 5 (御坂)

傻傻的木瓜

4#
发表于 Post on 2025-9-3 17:26:23 | 只看该作者 Only view this author
wocaishiniu 发表于 2025-9-3 16:55
我是按照做HOMO-LUMO那个方法做的

我不知道你说的是社长或者其他人介绍的哪个方法,用的材质是VMD内置的还是自定义的,“过了一段时间”涉及哪些VMD运行环境或者脚本使用的变动,以及这个反光效果究竟是否需要……这样问问题就算是在原始帖子底下也不容易回答,所以我只能泛泛而谈。我不建议把VMD以及论坛上一大堆脚本当黑箱用,稍微花点时间玩一玩软件读一读手册就能弄清楚很多问题。
√546=23.36664289109

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124671

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2025-9-4 07:57:13 | 只看该作者 Only view this author
wocaishiniu 发表于 2025-9-3 16:55
我是按照做HOMO-LUMO那个方法做的

认真看此文,描述情况必须精确,不得含糊其辞
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚、完整
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

自己添加一堆乱七八糟多余的步骤,只会把情况搞复杂,本来下文就没有你说的这个步骤
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html

你用的显示分子结构的材质明显是用的下文的做法,而下文又根本不直接牵扯绘制IGMH(而且此文的做法又不仅仅牵扯到HOMO、LUMO,而是可以绘制任意轨道,你的描述明显有误导性)
用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法(含演示视频)
http://sobereva.com/449http://bbs.keinsci.com/thread-11550-1-1.html

显然问问题的时候必须把全部流程严谨地描述出来,否则谁知道你到底都具体做了什么,不可能准确回答

我当前能告诉你的是,把当前用的显示等值面的材质的mirror设成0就不可能出现那种镜像效果

并且注意以后发帖时候帖子标题要尽可能具体,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你不恰当的标题“使用VMD作图求助”改了,以后注意!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

18

帖子

0

威望

182

eV
积分
200

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-4 11:01:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-4 07:57
认真看此文,描述情况必须精确,不得含糊其辞
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体 ...

好的,谢谢社长,麻烦了,以后注意

18

帖子

0

威望

182

eV
积分
200

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-4 11:06:43 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-9-3 17:26
我不知道你说的是社长或者其他人介绍的哪个方法,用的材质是VMD内置的还是自定义的,“过了一段时间”涉 ...

怪我没描述清楚,其实我是想要这个镜面反射的。整个步骤是先按照社长发的IGMH分析文章中的步骤操作,然后打开分子的颜色是根据社长发的设置轨道等值面图的方法做的,就是从VMDrender.txt复制的命令,最后保存渲染也都是安装步骤一步步做的。第一个有镜面的是三个月前做的,后面没镜面的是这几天做的。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-24 03:10 , Processed in 0.273973 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list