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[ORCA] 关于ESD的UV吸收计算请教

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本帖最后由 yzh 于 2025-6-15 13:41 编辑

各位论坛老师:
       我在参照orca6.0.1的苯计算振动分辨的UV吸收光谱,参考了例子的设置方式
inp的设置方式如下
! B3LYP/G def2-SVP def2/J ESD(ABS) tightSCF CPCM(TOLUENE)  
%maxcore  2000  
%pal nprocs  48 end
%tddft
nroots 5
iroot 1
end
%esd  
GSHESSIAN     "E001_GS.hess"  
DOHT          TRUE  
HESSFLAG    AHAS  
end
* xyzfile   0   1  E001_GS.xyz

但是计算的结果UV图只是一条曲线(没有任何的振动分辨),输出文件spectrum及其作图如附件所示。

请教一下老师,我想计算190-800nm波长的振动分辨UV吸收光谱。
修正后的inp如下,是否正确?谢谢

! B3LYP/G def2-SVP def2/J ESD(ABS) tightSCF CPCM(TOLUENE)  
%maxcore  2000  
%pal nprocs  48 end
%tddft
nroots 30
end
%esd  
GSHESSIAN     "E001_GS.hess"  
DOHT          TRUE  
HESSFLAG    AHAS  
end
* xyzfile   0   1  E001_GS.xyz

1.png (28.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 115)

1.png

E001_UV.spectrum

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发表于 Post on 2025-6-15 15:56:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2025-6-15 15:58 编辑

参见手册中这段表述

另外ORCA中做ESD计算,个人经验是,在内存首先得情况下,优先推荐少核但每个核多分配一些内存数。

微信截图_20250615155631.png (77.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 94)

微信截图_20250615155631.png

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发表于 Post on 2025-6-15 16:16:11 | 只看该作者 Only view this author
按照我的理解振动分辨光谱应该做的是两个态之间的振动跃迁吧 那怎么做190-800nm的呢?
比如算S0-S1之间的,那S2,S3等等直到你写的S30这些并没有考虑振动电子耦合效应吧
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-15 16:19:45 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-6-15 16:16
按照我的理解振动分辨光谱应该做的是两个态之间的振动跃迁吧 那怎么做190-800nm的呢?
比如算S0-S1之间的 ...

我想做多个态的振动分辨光谱,比如S1,S2,S3....S10,这样就能覆盖190-900nm的光谱范围,S0的结构我已经优化好了(E001_GS.hess)

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发表于 Post on 2025-6-15 16:22:02 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2025-6-15 16:30 编辑
yzh 发表于 2025-6-15 16:19
我想做多个态的振动分辨光谱,比如S1,S2,S3....S10,这样就能覆盖190-900nm的光谱范围,S0的结构我已经优 ...

那你可能得算10次振动分辨然后全叠一起

并非 见楼下
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-15 16:22:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yzh 于 2025-6-15 16:23 编辑
cokie 发表于 2025-6-15 15:56
参见手册中这段表述

另外ORCA中做ESD计算,个人经验是,在内存首先得情况下,优先推荐少核但每个核多分 ...

手册给的例子就是用的GS的HESS和xyz。不知道,这边吸收用ES,但是发射却用GS?
内存设置这个我试过48cores,用2000M每个核心没有问题

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发表于 Post on 2025-6-15 16:29:21 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2025-6-15 16:33 编辑
wal 发表于 2025-6-15 16:22
那你可能得算10次振动分辨然后全叠一起

哦,翻了翻手册,我看到ORCA给出了一次性算一堆态的输入方式

但我没搞懂为什么只输入一个S1的hess就能算20个,2-20都是AHAS现算的么?那估计耗时就要比较哈人了

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某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-15 16:41:33 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-6-15 16:29
哦,翻了翻手册,我看到ORCA给出了一次性算一堆态的输入方式

但我没搞懂为什么只输入一个S1的hess就能 ...

谢谢,我也是参考这个算例,如果想算20个态的话。应该是这样的(不知道对不对):
! B3LYP/G def2-SVP def2/J ESD(ABS) tightSCF CPCM(TOLUENE)  
%maxcore  2000  
%pal nprocs  48 end
%tddft
nroots 20
end
%esd  
GSHESSIAN     "E001_GS.hess"  
DOHT          TRUE  
STATES        1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20
HESSFLAG    AHAS  
end
* xyzfile   0   1  E001_GS.xyz

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发表于 Post on 2025-6-15 16:50:40 | 只看该作者 Only view this author
yzh 发表于 2025-6-15 16:41
谢谢,我也是参考这个算例,如果想算20个态的话。应该是这样的(不知道对不对):
! B3LYP/G def2-SVP d ...

我一般直接上AH的,没怎么用过AHAS,因为我算光谱都是激发态分析完了顺带的,所以不知道你画出来光谱没有振动峰是不是AHAS模型的原因
别的设置看着也没什么问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-15 16:52:29 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-6-15 16:50
我一般直接上AH的,没怎么用过AHAS,因为我算光谱都是激发态分析完了顺带的,所以不知道你画出来光谱没有 ...

好的,谢谢
那我用AH计算试试

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发表于 Post on 2025-6-15 18:48:17 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2025-6-15 20:53 编辑
yzh 发表于 2025-6-15 16:22
手册给的例子就是用的GS的HESS和xyz。不知道,这边吸收用ES,但是发射却用GS?
内存设置这个我试过48cor ...

Note: 下述回答有偏颇,请参考后面 wzk5chem 老师对本层的回复

对于AHAS模型,我倾向于手册里只是没有标注S1,但其实使用的是S1的xyz。
毕竟前面在“吹”这个方法的时候,还有这么一段话,如图。


QQ截图20250615193229.jpg (164.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 108)

QQ截图20250615193229.jpg

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发表于 Post on 2025-6-15 18:59:48 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2025-6-15 18:48
手册里只是没有标注S1,但其实使用的是S1的xyz。
包含后面用ESD模块做PHOSP,给的也是没后缀的xyz,你不 ...

这里我也有点疑问,我用Gaussian算的振动分辨时候确实算吸收的时候要用S1的结构,但是ORCA手册里给了一句调用ESD的时候xyz里的结构要匹配基态hess

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发表于 Post on 2025-6-15 19:36:29 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-6-15 18:59
这里我也有点疑问,我用Gaussian算的振动分辨时候确实算吸收的时候要用S1的结构,但是ORCA手册里给了一句 ...

这个Important应该只针对上述的AH模型吧(我推测的,毕竟是紧跟在AH模型之后写的)
像用ESD模块计算ISC,用的也是末态(T1),所以ESD模块的使用应该没有“必须采用 GS geometry ”这一限制

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-15 19:43:11 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2025-6-15 18:48
对于AHAS模型,我倾向于手册里只是没有标注S1,但其实使用的是S1的xyz。
毕竟前面在“吹”这个方法的时 ...

我也觉得奇怪,上面的AH还有VG都是GS.hess和S1.hess都需要的,到了AHAS不需要S1.hess,只需要GS.hess。这样的话用AHAS只需要先算GS的opt+freq就行了,少算一个S1的opt。岂不是更加友好。

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发表于 Post on 2025-6-15 19:57:19 | 只看该作者 Only view this author
yzh 发表于 2025-6-15 19:43
我也觉得奇怪,上面的AH还有VG都是GS.hess和S1.hess都需要的,到了AHAS不需要S1.hess,只需要GS.hess。这 ...

我看手册里,他的噱头就是这个,特别是orca至今还没有解析hessian,所以省了很多时间。
但这种近似我个人体验下来,对于“共轭片段可旋转”这一因素的描述比较看脸。

对于振动光谱,我目前用 gaussian 用的多,确实要快很多。
缺点就是报错太多,万不得已就用 gaussian 做 freq,再用公社里的方法,转换成 .hess 然后用 ORCA 算,但不得不说,即使是ORCA 6.0.1 , ESD 模块的计算速度依然是慢(当然也可能是我的分子比较大)。

另外 FCclasses 出的振动光谱也很漂亮,我很喜欢他可视化程序出的图。

本版积分规则 Credits rule

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