求助使用gmx_MMPBSA计算熵，σ(Int. Energy) > 3.6怎么解决

lzy233

1. Normal [ -TΔS ]
   
2. ENTROPY RESULTS (INTERACTION ENTROPY):
   
3. Energy Method          Entropy σ(Int. Energy)    Average           SD        SEM
   
4. -------------------------------------------------------------------------------
   
5. GB                          IE          4.22      14.37         2.78       0.06
   
6. 
   
7. -------------------------------------------------------------------------------
   
8. -------------------------------------------------------------------------------
   
9. WARNING: THE INTERACTION ENERGY STANDARD DEVIATION [ σ(Int. Energy) ]
   
10. IS GREATER THAN 3.6 kcal/mol (~15 kJ/mol). THUS, THE INTERACTION ENTROPY VALUES ARE
    
11. NOT RELIABLE. CHECK THIS PAPER FOR MORE INFO (https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00374)

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使用gmx_MMPBSA计算熵，σ(Int. Energy) > 3.6怎么解决？

lmtt

你好，请问解决了吗？我也遇到了这个问题

jackshoulder

建议你贴上mmpbsa.in文化作为参数文件进行详细分析，很大可能是你的参数设置不正确，导致。