对膜两侧的溶剂进行控温遇到一些问题

lll123

各位老师好，我想实现对膜两侧中的水溶液进行控温（SOL 300 K），(SOL1 330 K)。遇到一些问题，没有解决。请各位大佬帮帮忙。

mdp控温参数是
tcoupl          = V-rescale                 ; More accurate thermost
tc-grps         = SOL  SOL1     ; three coupling groups - more accurate
tau_t           = 0.2  0.2              ; time constant, in ps
ref_t           = 300  330    ; reference temperature, one for each group,
可以正常生成tpr文件，但是运行tpr文件会报错
报错如下：
The [molecules] section of your topology specifies more than one block of
a [moleculetype] with a [settles] block. Only one such is allowed.
If you are trying to partition your solvent into different *groups*
(e.g. for freezing, T-coupling, etc.), you are using the wrong approach. Index
files specify groups. Otherwise, you may wish to change the least-used
block of molecules with SETTLE constraints into 3 normal constraints

sobereva

整个拓扑文件里只能有一处[settles]。貌似你设了两个水的moleculetype，都有[settles]，所以无法模拟。不要用两个moleculetype，而应当用索引组通过序号指定两块区域的水作为不同的控温组

注意求助帖要在标题里体现目的是求助，注意看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。这次给你改了