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[新手求助] 用def2-SVP计算相互作用能报错syntax error

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目的是计算有机配体和Pb的相互作用能,使用b3lyp/def2-SVP基组,counterpoise=2分段。gjf附件已上传。
但是运行时(在超算平台运行)报错,显示“# opt b3lyp/def2-SVP scrf=(solvent=water) counterpoise=2 --------------------------------------------------------
QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
# opt b3lyp/def2-SVP scrf=(solvent=water
             '
Last state= "GCL"
TCursr=      3918 LCursr=        12
Error termination via Lnk1e in /work/home/ac1ykaxvhm/apprepo/gaussian/16-hy/scripts/../app/g16/l1.exe at Sun Jun  1 21:47:16 2025.
Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  4.0 seconds.
Elapsed time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      6 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1”
我自己推测可能原因:1.是我语句写错了?2.是超算平台没有def2-SVP基组导致报错?(因为g16a.03似乎没有自带def2基组)
求助大佬们帮助解答一下。


opPb.gjf

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发表于 Post on 2025-6-1 22:49:31 | 只看该作者 Only view this author
这个最好加上d3bj,如果配体有负电荷,还要考虑弥散。高斯里面def2没有那个杠。另外counterpoise算的话def2svp不够意思,怎么也得上到def2tzvp或者def2tzvpp

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发表于 Post on 2025-6-1 23:08:39 | 只看该作者 Only view this author
语法错误,def2-SVP写作def2svp

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发表于 Post on 2025-6-1 23:19:45 | 只看该作者 Only view this author
硬伤太多了。基组关键词没写对只是其一

B3LYP不带色散校正根本没法优化这个,注意看下文
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413

优化时候不要带着counterpoise,并且counterpoise没法直接带着隐式溶剂模型用,下文明确说了
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46

当前情况就算纯粹是计算相互作用能,也不推荐用counterpoise,看
计算化学键键能时以counterpoise方式考虑BSSE不仅是多余的甚至是有害的
http://sobereva.com/381http://bbs.keinsci.com/thread-6047-1-1.html

而且counterpoise的片段设置根本不是那么写的,好好看前面的博文。怕不是真被坑爹的AI的回复给坑了。

而且算相互作用能用def2-SVP这么小的基组完全是开玩笑,起码对Pb和与之紧密相互作用的原子要用def2-TZVP(用ma-TZVP更好)。仔细看下文
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

此外,当前是水环境,羧基应当用质子解离状态来算。

当前的计算真是完全不堪入目,倒处都是硬伤。建议先好好学学基础再做计算:
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355http://bbs.keinsci.com/thread-4447-1-1.html
北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC




北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-1 23:36:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-1 23:19
硬伤太多了。基组关键词没写对只是其一

B3LYP不带色散校正根本没法优化这个,注意看下文

多谢社长回复,受教了,刚接触量化计算确实好多不太懂。我看到您的博文里写到counterpoise的片段设置是在每个原子坐标后面添加编号,我这个体系较大,有100多个原子,每个手动添加编号比较繁琐,还想请教一下是否有快速的方法针对大量原子进行片段设置?

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发表于 Post on 2025-6-1 23:57:31 | 只看该作者 Only view this author
121089576 发表于 2025-6-1 23:36
多谢社长回复,受教了,刚接触量化计算确实好多不太懂。我看到您的博文里写到counterpoise的片段设置是在 ...

在GaussView里定义片段后保存gjf。参考北京科音中级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KBQC)幻灯片:


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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