计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 15249|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[其它量化程序] 求助DMol3几何优化能量不收敛问题

[复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

293

eV
积分
307

Level 3 能力者

求教各位老师,构建了一个石墨炔薄片与一条寡聚物链的模型,DMol3几何优化收敛情况不好,应该是什么原因呢?怎么修改参数呢,下面是我的输出文件和参数设置

9H86{49[HE1XVCV7}C{]ZDF.png (33.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 88)

9H86{49[HE1XVCV7}C{]ZDF.png

33_WX}MQJ5P$2F1KLA`KGD9.png (36.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 88)

33_WX}MQJ5P$2F1KLA`KGD9.png

`92NQA{211M(X@CAIP1M~TB(1).png (7.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 68)

结果

结果

EQGD]6~PI2G(%J[$P)PEBIY(1).png (11.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 75)

输入文件

输入文件

1242

帖子

1

威望

3668

eV
积分
4930

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2021-1-8 14:29:10 | 只看该作者 Only view this author
搭的是周期性体系还是孤立体系

14

帖子

0

威望

293

eV
积分
307

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-8 15:20:44 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2021-1-8 14:29
搭的是周期性体系还是孤立体系

老师您好,一开始是大的周期性结构,原子个数太多无法计算,经过优化又取出来的小的孤立体系,模型为一个石墨炔片和一条几个聚合度的链

1242

帖子

1

威望

3668

eV
积分
4930

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2021-1-8 18:15:21 | 只看该作者 Only view this author
居里的小迷妹 发表于 2021-1-8 15:20
老师您好,一开始是大的周期性结构,原子个数太多无法计算,经过优化又取出来的小的孤立体系,模型为一个 ...

孤立体系那就甭用dmol3了

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120062

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2021-1-9 04:49:12 | 只看该作者 Only view this author
你的这种体系必须描述色散作用才可能优化出靠谱的结构,居然用描述色散作用垃圾的PBE还不带任何色散校正,结果根本没法要

仔细看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html

Dmol3算孤立体系很烂,仔细看
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/508

你这种问题,先用Gaussian在PM7下或者xtb在GFN-xTB下做个预优化,然后用Gaussian在B3LYP-D3(BJ)下或者免费的ORCA在B97-3c下下进一步优化,才是又好又快的做法。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

14

帖子

0

威望

293

eV
积分
307

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-10 15:57:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-9 04:49
你的这种体系必须描述色散作用才可能优化出靠谱的结构,居然用描述色散作用垃圾的PBE还不带任何色散校正, ...

感谢老师指导,我重新尝试,谢谢

38

帖子

0

威望

537

eV
积分
575

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2021-3-4 15:57:49 | 只看该作者 Only view this author
请问您这个Dmol3优化不收敛是怎么解决的呢? 遇到相似的问题了想请教一下

3753

帖子

3

威望

1万

eV
积分
19663

Level 6 (一方通行)

围观吃瓜群众

8#
发表于 Post on 2021-3-4 16:18:31 | 只看该作者 Only view this author
xiapin 发表于 2021-3-4 15:57
请问您这个Dmol3优化不收敛是怎么解决的呢? 遇到相似的问题了想请教一下

多给些详细信息,诸如收敛的情况结构等,DMol3对优化结构能调整的参数、算法并不是很多。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

6

帖子

0

威望

23

eV
积分
29

Level 2 能力者

9#
发表于 Post on 2025-6-17 09:26:45 | 只看该作者 Only view this author
后续如何解决的呢,调大迭代次数?增大smearing?请教一下,谢谢。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 21:52 , Processed in 0.169156 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list