ORCA DLPNO-CCSD计算报错

R-S

最近在使用orca做DLPNO-CCSD计算，简直太崩溃了，运行没一次能正常跑完的，总是各种花样的报错，完全不知道如何调试或者修改，一个报错就能卡一天，有没有大佬给点建议，这样学习成本也太高了。
刚刚又遇到一个报错，实在没有头绪，还请各位大佬帮我看一看到底是什么原因，
输入文件：
! DLPNO-CCSD(T) tightPNO RIJCOSX def2-TZVPP def2/J def2-TZVPP/C tightSCF noautostart miniprint
%maxcore     3000
%pal nprocs   32 end
* xyz  -1  14
坐标
*

出现如下报错：
UseSFitting                                  ... on
Initializing property integral containers    ... done (  0.0 sec)

SHARK setup successfully completed in   8.6 seconds

Maximum memory used throughout the entire STARTUP-calculation: 87.1 MB
Initializing property integral containers    ... done (  0.0 sec)

SHARK setup successfully completed in   8.8 seconds

Maximum memory used throughout the entire STARTUP-calculation: 87.1 MB
Initializing property integral containers    ... done (  0.0 sec)

SHARK setup successfully completed in   8.8 seconds

Maximum memory used throughout the entire STARTUP-calculation: 87.1 MB
Initializing property integral containers    ... done (  0.0 sec)

SHARK setup successfully completed in   8.9 seconds

Maximum memory used throughout the entire STARTUP-calculation: 87.1 MB
[file orca_tools/qcmatshared.cpp, line 992]: Error TSharedMatrixSym<T>::Retrieve(FILE *f)! Trying to retrieve a non-symmetric matrix into a TRSharedMatrixSym


ORCA finished by error termination in Startup
Calling Command: mpirun -np 32  /home/lxl/ORCA/orca_startup_mpi fe4c6-6A-DLPNO-CCSD.int.tmp fe4c6-6A-DLPNO-CCSD
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 394]:
  .... aborting the run
这是什么原因呢？第一次运行还是能计算的，后面提示内存不足终止了，然后删除了所有临时文件，调整内存分配，再次计算就这样了，真是让人头大，不知道这样五花八门的报错到底从哪里去查找解决方案呢？求各位支个招  


中间做了一些内存和并行核数修改，其中一个报错的输出文件如下：



运行orca --version 得到的信息如下：
orca --v

                                 *****************
                                 * O   R   C   A *
                                 *****************

                                            #,                                       
                                            ###                                      
                                            ####                                    
                                            #####                                    
                                            ######                                   
                                           ########,                                 
                                     ,,################,,,,,                        
                               ,,#################################,,                 
                          ,,##########################################,,            
                       ,#########################################, ''#####,         
                    ,#############################################,,   '####,        
                  ,##################################################,,,,####,      
                ,###########''''           ''''###############################      
              ,#####''   ,,,,##########,,,,          '''####'''          '####      
            ,##' ,,,,###########################,,,                        '##      
           ' ,,###''''                  '''############,,,                           
         ,,##''                                '''############,,,,        ,,,,,,###''
      ,#''                                            '''#######################'''  
     '                                                          ''''####''''         
             ,#######,   #######,   ,#######,      ##                                
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             '#######'   ##     ##  '#######'  #'      '#     '####' # '####'        



                #########################################################
                #                        -***-                          #
                #          Department of theory and spectroscopy        #
                #                                                       #
                #                      Frank Neese                      #
                #                                                       #
                #     Directorship, Architecture, Infrastructure        #
                #                    SHARK, DRIVERS                     #
                #        Core code/Algorithms in most modules           #
                #                                                       #
                #        Max Planck Institute fuer Kohlenforschung      #
                #                Kaiser Wilhelm Platz 1                 #
                #                 D-45470 Muelheim/Ruhr                 #
                #                      Germany                          #
                #                                                       #
                #                  All rights reserved                  #
                #                        -***-                          #
                #########################################################


                         Program Version 6.0.1  -  RELEASE   -


With contributions from (in alphabetic order):
[Max-Planck-Institut fuer Kohlenforschung]                              
  Daniel Aravena         : Magnetic Suceptibility                        
  Michael Atanasov       : Ab Initio Ligand Field Theory (pilot matlab implementation)
  Alexander A. Auer      : GIAO ZORA, VPT2 properties, NMR spectrum      
  Ute Becker             : All parallelization in ORCA, NUMFREQ, NUMCALC
  Giovanni Bistoni       : ED, misc. LED, open-shell LED, HFLD           
  Martin Brehm           : Molecular dynamics                           
  Dmytro Bykov           : pre 5.0 version of the SCF Hessian            
  Marcos Casanova-Páez   : Triplet and SCS-CIS(D). UHF-(DLPNO)-IP/EA/STEOM-CCSD. UHF-CVS-IP/STEOM-CCSD   
  Vijay G. Chilkuri      : MRCI spin determinant printing, contributions to CSF-ICE
  Pauline Colinet        : FMM embedding                                 
  Dipayan Datta          : RHF DLPNO-CCSD density                        
  Achintya Kumar Dutta   : EOM-CC, STEOM-CC                              
  Nicolas Foglia         : Exact transition moments, OPA infrastructure, MCD improvements   
  Dmitry Ganyushin       : Spin-Orbit,Spin-Spin,Magnetic field MRCI      
  Miquel Garcia-Rates    : C-PCM and meta-GGA Hessian, CCSD/C-PCM, Gaussian charge scheme
  Tiago L. C. Gouveia    : GS-ROHF, GS-ROCIS                             
  Yang Guo               : DLPNO-NEVPT2, F12-NEVPT2, CIM, IAO-localization        
  Andreas Hansen         : Spin unrestricted coupled pair/coupled cluster methods
  Ingolf Harden          : AUTO-CI MPn and infrastructure               
  Benjamin Helmich-Paris : MC-RPA, TRAH-(SCF,CASSCF), AVAS, COSX integrals, SCF dyn. polar.
  Lee Huntington         : MR-EOM, pCC                                   
  Robert Izsak           : Overlap fitted RIJCOSX, COSX-SCS-MP3, EOM     
  Riya Kayal             : Wick's Theorem for AUTO-CI, AUTO-CI UHF-CCSDT
  Emily Kempfer          : AUTO-CI, RHF CISDT and CCSDT                  
  Christian Kollmar      : KDIIS, OOCD, Brueckner-CCSD(T), CCSD density, CASPT2, CASPT2-K, improved NEVPT2
  Axel Koslowski         : Symmetry handling                             
  Simone Kossmann        : meta-GGA functionals, TD-DFT gradient, OOMP2, (MP2 Hessian; deprecated post 5.0)
  Lucas Lang             : DCDCAS                                       
  Marvin Lechner         : AUTO-CI (C++ implementation), FIC-MRCC        
  Spencer Leger          : CASSCF response                              
  Dagmar Lenk            : GEPOL surface, SMD, ORCA-2-JSON               
  Dimitrios Liakos       : Extrapolation schemes; Compound Job, initial MDCI parallelization
  Dimitrios Manganas     : Further ROCIS development; embedding schemes. LFT, Crystal Embedding
  Dimitrios Pantazis     : SARC Basis sets                              
  Anastasios Papadopoulos: AUTO-CI, single reference methods and gradients
  Taras Petrenko         : pre 6.0 DFT Hessian and TD-DFT gradient, (ASA, deprecated), ECA, 1-Electron XAS/XES, NRVS
  Peter Pinski           : DLPNO-MP2, DLPNO-MP2 Gradient                 
  Christoph Reimann      : Effective Core Potentials                     
  Marius Retegan         : Local ZFS, SOC                                
  Christoph Riplinger    : Optimizer, TS searches, QM/MM, DLPNO-CCSD(T), (RO)-DLPNO pert. Triples
  Michael Roemelt        : Original ROCIS implementation                 
  Masaaki Saitow         : Open-shell DLPNO-CCSD energy and density      
  Barbara Sandhoefer     : DKH picture change effects                    
  Kantharuban Sivalingam : CASSCF convergence/infrastructure, NEVPT2 and variants, FIC-MRCI
  Bernardo de Souza      : ESD, SOC TD-DFT                              
  Georgi L. Stoychev     : AutoAux, RI-MP2 NMR, DLPNO-MP2 response, X2C  
  Van Anh Tran           : RI-MP2 g-tensors                              
  Willem Van den Heuvel  : Paramagnetic NMR                              
  Zikuan Wang            : NOTCH, Electric field optimization            
  Frank Wennmohs         : Technical directorship and infrastructure     
  Hang Xu                : AUTO-CI-Response properties                  

[FACCTs GmbH]                                                            
  Markus Bursch, Miquel Garcia-Rates, Christoph Riplinger, Bernardo de Souza, Georgi L. Stoychev

  APM, Basis sets (HGBS, AHGBS, def-TZVP (Ac-Lr), def2-XVPD (La-Lu)), CI-OPT, improved COSX, DLPNO-Multilevel,           
  DOCKER, DRACO, updates on ESD, GOAT, IRC, LR-CPCM, MBIS, meta-GGA TD-DFT gradient, ML-optimized integration grids,
  MM, NACMEs, nearIR, NEB, NEB-TS, NL-DFT gradient (VV10), 2- and 3-layer-ONIOM, interface openCOSMO-RS, QMMM,   
  Crystal-QMMM, SF, symmetry and pop. for TD-DFT, r2SCAN hybrids, SOLVATOR                                   

[Other institutions]                                                     
  V. Asgeirsson          : NEB                                          
  Christoph Bannwarth    : sTDA-DFT, sTD-DFT, PBEh-3c, B97-3c, D3        
  Sebastian Ehlert       : rSCAN, r2SCAN, r2SCAN-3c, D4, dhf basis sets  
  Marvin Friede          : D4 for Fr, Ra, Ac-Lr                          
  Lars Goerigk           : TD-DFT with DH, B97 family of functionals     
  Stefan Grimme          : VdW corrections, initial TS optimization, DFT functionals, gCP, sTDA/sTD-DF
  Waldemar Hujo          : DFT-NL                                       
  H. Jonsson             : NEB                                          
  Holger Kruse           : gCP                                          
  Marcel Mueller         : wB97X-3c, vDZP basis set                     
  Hagen Neugebauer       : wr2SCAN                                       
  Tobias Risthaus        : range-separated hybrid DFT                    
  Lukas Wittmann         : regularized MP2, r2SCAN double-hybrids, wr2SCAN        

We gratefully acknowledge several colleagues who have allowed us to      
interface, adapt or use parts of their codes:                           
  Ed Valeev, F. Pavosevic, A. Kumar             : LibInt (2-el integral package), F12 methods
  Garnet Chan, S. Sharma, J. Yang, R. Olivares  : DMRG                  
  Ulf Ekstrom                                   : XCFun DFT Library      
  Mihaly Kallay                                 : mrcc  (arbitrary order and MRCC methods)
  Frank Weinhold                                : gennbo (NPA and NBO analysis)           
  Simon Mueller                                 : openCOSMO-RS                           
  Christopher J. Cramer and Donald G. Truhlar   : smd solvation model                     
  S Lehtola, MJT Oliveira, MAL Marques          : LibXC Library                           
  Liviu Ungur et al                             : ANISO software                          


Your calculation uses the libint2 library for the computation of 2-el integrals
For citations please refer to: http://libint.valeyev.net

Your ORCA version has been built with support for libXC version: 6.2.2
For citations please refer to: https://libxc.gitlab.io

This ORCA versions uses:
   CBLAS   interface :  Fast vector & matrix operations
   LAPACKE interface :  Fast linear algebra routines
   SCALAPACK package :  Parallel linear algebra routines
   Shared memory     :  Shared parallel matrices
   BLAS/LAPACK       :  OpenBLAS 0.3.27  USE64BITINT DYNAMIC_ARCH NO_AFFINITY Haswell SINGLE_THREADED
        Core in use  :  Haswell
   Copyright (c) 2011-2014, The OpenBLAS Project


[file orca_main/run.cpp, line 380]: Cannot open input file: --v

[file orca_main/run.cpp, line 380]: Cannot open input file: --v

应该是安装成功了，但是输出的信息很多，不知道是不是存在什么问题

wzkchem5

是不是这个任务之前报错了，你修改了输入文件又重跑，但是重跑之前忘了删掉上一次跑生成的临时文件？
另外，是不是你用mpirun调用了orca？orca并行计算不是用mpirun调用的

R-S

wzkchem5 发表于 2025-6-16 17:31
是不是这个任务之前报错了，你修改了输入文件又重跑，但是重跑之前忘了删掉上一次跑生成的临时文件？
另外 ...

之前报错过，但是我不知道临时文件是在哪里，运行的时候输入文件所在的目录全部都是.tmp和一些他其他的文件，我已经都删除了，/tmp目录下也有一个临时文件夹但是里面都是空的目录，我也给删掉了，然后还是会报错。“是不是你用mpirun调用了orca”，因为我刚开始学习使用orca，所以这个不是我设置的，是他自己运行时自己操作的吗？ 开壳层体系，单电子比较多，用CCSD(t)计算单点实在是没办法收敛，想用DLPNO-CCSD计算一下看看，想请问您这种单电子非常多的体系是不是不适合用CCSD(t),那如果想做一个比较可靠的能量计算有什么方法可以考虑呢？非常感谢您！

wzkchem5

R-S 发表于 2025-6-16 17:39
之前报错过，但是我不知道临时文件是在哪里，运行的时候输入文件所在的目录全部都是.tmp和一些他其他的文 ...

你是如何调用orca的？是否使用了非orca官方提供的任何脚本（包括任何人写的博文里提供的脚本），如果使用了，都上传上来

R-S

wzkchem5 发表于 2025-6-16 18:14
你是如何调用orca的？是否使用了非orca官方提供的任何脚本（包括任何人写的博文里提供的脚本），如果使用 ...

没有使用脚本，orca是从官网下载的6.0版本的然后解压，设置的变量，运行就是用的 orca *.inp > *.out ,我把orca --version输出信息贴上去.

wal

R-S 发表于 2025-6-16 18:34
没有使用脚本，orca是从官网下载的6.0版本的然后解压，设置的变量，运行就是用的 orca *.inp > *.out ,我 ...

orca并行的时候要写完整路径

R-S

wal 发表于 2025-6-16 19:10
orca并行的时候要写完整路径

您说的是*.inp这个要用完整路径吗？*是我省略了文件名，我是在文件 目录下运行的orca，不知道您说的这个完整路径指的是绝对路径吗

wal

R-S 发表于 2025-6-16 20:40
您说的是*.inp这个要用完整路径吗？*是我省略了文件名，我是在文件 目录下运行的orca，不知道您说的这个 ...

对，是orca程序需要绝对路径
path/to/orca xx.inp > xx.out
你加上试试看

R-S

wal 发表于 2025-6-16 20:43
对，是orca程序需要绝对路径
path/to/orca xx.inp > xx.out
你加上试试看

好的，我换成绝对路径了，还是同样的报错

wzkchem5

R-S 发表于 2025-6-16 20:40
您说的是*.inp这个要用完整路径吗？*是我省略了文件名，我是在文件 目录下运行的orca，不知道您说的这个 ...

是orca要绝对路径，不是*.inp要绝对路径

R-S

wzkchem5 发表于 2025-6-16 20:47
是orca要绝对路径，不是*.inp要绝对路径

用的是orca的绝对路径，我感觉是不是orca安装的不对，或者缺少什么东西

wzkchem5

R-S 发表于 2025-6-16 20:45
好的，我换成绝对路径了，还是同样的报错

“Initializing property integral containers”还是打印了同样多次？
输出文件但凡有一点变动，都要上传完整的输出文件，以防输出文件其他部分的细节出现变化你没注意

R-S

wzkchem5 发表于 2025-6-17 08:24
“Initializing property integral containers”还是打印了同样多次？
输出文件但凡有一点变动，都要上 ...

好的王老师，我上传一下输出文件