求助：请问如何将pdb文件重新编号为Aho编号？

koko525 · 发表于 Post on 2024-10-23 09:04:49

Rosetta antibody design教程中，需要将pdb文件重新进行编号，编号方案为Aho编号系统，这样后续才可以被Rosetta正确识别。

官方推荐了转化工具PyIgClassify（PyIgClassify: An antibody CDRs clusters web site (fccc.edu)），但是该网站不再和过去一样提供submit选项，无法上传本地pdb或者fasta文件。

目前纽普生物-抗体序列编号-在线工具可以选择Aho编号系统对氨基酸序列进行编号，但是输出结果无法下载。

:]]]]] · 发表于 Post on 2025-7-16 11:03:21

参考github.com/oxpig/ANARCI/Example_scripts_and_sequences/ImmunoPDB.py

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[分子对接] 求助：请问如何将pdb文件重新编号为Aho编号？

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