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[ORCA] 含自由H结构的几何优化不收敛问题

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本帖最后由 Iris_1 于 2023-6-11 12:08 编辑

需要用ORCA计算2-fluoro-2,2-dinitroethanol分子失去-OH基团中的H原子的能垒,准备用NEBTS方法。在准备产物结构时,用Avogadro软件断开H键,并用GAFF力场优化了一下,用力场优化后的结构作为初始结构进行OPT FREQ计算,结果提示优化圈数已经达到上限,优化不收敛,而且最后一步的xyz文件H原子又与O原子相连了。

ERROR !!!       The optimization did not converge but reached the maximum number of optimization cycles.
       As a subsequent Frequencies calculation has been requested ORCA will abort at this point of the run.
       Please restart the calculation with the lowest energy geometry and/or a larger maxiter for the geometry optimization.
猜测可能是初始的优化结构不合理,求问H原子的位置如何摆放使得初始结构更合理;
如果不是初始结构的问题,该如何解决呢?谢谢解答~

附件为结构优化的初始结构图及xyz文件
inp文件为:
! B3LYP D4 def2-TZVP def2/J RIJCOSX OPT FREQ verytightSCF miniprint nopop
%maxcore 1500
%pal nprocs 4 end

*xyz 0 1
C          1.68175        0.39929       -0.28502
C          0.65916        1.36320        0.36890
N          0.86953        1.39450        1.90569
O          1.96280        1.73657        2.32801
O         -0.04559        0.98693        2.60152
N          0.86054        2.83351       -0.11093
O          0.07265        3.67243        0.29718
O          1.85110        3.09749       -0.77420
F         -0.56147        1.09710       -0.14435
O          1.43952       -0.95282        0.11553
H          2.69706        0.68335        0.00353
H          1.59805        0.46593       -1.37271
H          3.83933       -1.71013        2.81878
*



结构优化的初始结构.JPG (49.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

用于结构优化的初始结构

用于结构优化的初始结构

prod.xyz

680 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2023-6-11 21:39:43 | 只看该作者 Only view this author
拿GAFF优化断键的状态完全莫名其妙,GAFF根本不可能靠谱地优化自由基体系。不要乱用分子力场
而且本身这种过程就是没势垒的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-11 21:56:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-11 21:39
拿GAFF优化断键的状态完全莫名其妙,GAFF根本不可能靠谱地优化自由基体系。不要乱用分子力场
而且本身这种 ...

谢谢sob老师的回复!冒昧再请教一下您,请问这种含自由基的结构如何优化才能收敛呢,以及您说的H键断裂没有势垒能否具体说一下(为什么是没有势垒的呢)。刚开始接触量化知识面还比较窄,感谢您的指导!

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发表于 Post on 2023-6-12 10:41:49 | 只看该作者 Only view this author
Iris_1 发表于 2023-6-11 21:56
谢谢sob老师的回复!冒昧再请教一下您,请问这种含自由基的结构如何优化才能收敛呢,以及您说的H键断裂没 ...

一律用量子化学方法优化
只有一个过程中同时有能量升高和降低因素才可能有势垒。简单的O-H键断裂几乎没有能量降低因素
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-12 19:21:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-12 10:41
一律用量子化学方法优化
只有一个过程中同时有能量升高和降低因素才可能有势垒。简单的O-H键断裂几乎没 ...

明白了,谢谢sob老师指导!

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