使用CP2K的metadynamic的后处理功能得到FES图后如何进一步得到最小能量路径

15670538028 · 发表于 Post on 2024-8-21 20:45:51

各位老师好，请问使用CP2K的metadynamic的后处理功能得到free energy surface（FES)图后，我得到最小能量路径就是根据图中能量低点和参考的等高线得到大致的中间体和过渡态的位置，然后连接起来，1审稿人问怎么从FES中得到最小能量路径，我这样做/描述有说服力吗？2得到最小能量路径，我也有看到一些软件插件的使用，有什么简单好用有说服力的插件推荐吗？3或者一些同样用metadynamics描述得到最小能量路径的文献推荐？

Daniel_Arndt · 发表于 Post on 2024-8-23 12:11:04

你可以看看 http://bbs.keinsci.com/thread-17796-1-1.html 和 http://bbs.keinsci.com/thread-20528-1-1.html 。

XXDD · 发表于 Post on 2025-8-11 11:06:07

请问一下得到的fes.dat文件的最后一列能量单位是多少呀

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[CP2K] 使用CP2K的metadynamic的后处理功能得到FES图后如何进一步得到最小能量路径

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